
Tetsu NARUMI
Department of Computer and Network Engineering | Professor |
Cluster I (Informatics and Computer Engineering) | Professor |
- Profile:
Apr. 1995 - Mar. 1998 : Special Postdoctoral Researcher,
Japan Society for the Promotion of Science
Apr. 1998 - Mar. 2001 : Special Postdoctoral Researcher,
RIKEN (Institute of Physical and Chemical Research)
Apr. 2001 - Mar. 2007 : Research Scientist,
High-Performance Molecular Simulation Team, RIKEN Genomic Sciences Center
Apr. 2007 - Mar. 2009 : Research Associate Professor,
Faculty of Science and Technology, Keio University
Apr. 2009 - Mar. 2013 : Associate Professor,
Department of Computer Science, University of Electro-Communications
(Department of Communication Engineering and Informatics from Apr.2010)
Apr. 2013 - Mar. 2016 : Professor,
Department of Communication Engineering and Informatics,
University of Electro-Communications
Apr. 2016 - Professor,
Department of Computer and Network Engineering,
University of Electro-Communications
Researcher Information
Educational Background
Research Activity Information
Award
- Mar. 2024
Information Processing Society of Japan, 情報処理学会創立10周年を記念して,昭和45年に創設された。機関誌に発表された論文のうち,特に優秀な著者に授与される.
An Implementation and Evaluation of a Remote Control System for Logic Circuit Design Assignment using an FPGA
IPSJ Outstanding Paper Award, Hideo Akaike;Toshiyuki Shimazaki;Tetsu Narumi
Official journal, Japan - Nov. 2009
ACM
USA
Gordon Bell Prize (Winner, Low Price / Performance Category)
United States - Nov. 2006
IEEE
USA
Gordon Bell Prize (Honorable Mention, Peak Performance)
United States - Nov. 2000
IEEE
USA
Gordon Bell Prize (Winner, Peak Performance)
United States - Sep. 1996
日経サイエンス社
AVS大賞(最優秀賞)
Paper
- A Hardware Solver for Simultaneous Linear Equations with Multistage Interconnection Network
Rikuya Tomii; Tetsu Narumi
14th International Symposium on Highly Efficient Accelerators and Reconfigurable Technologies (HEART'24)), ACM, 81-89, 19 Jun. 2024, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - An Implementation and Evaluation of a Remote Control System for Logic Circuit Design Assignment using an FPGA
Hideo Akaike; Toshiyuki Shimazaki; Tetsu Narumi
情報処理学会論文誌 教育とコンピュータ, 情報処理学会, 8, 2, 51-63, Jun. 2022, Peer-reviwed
Scientific journal, Japanese - Estimating Configuration Parameters of Pipelines for accelerating N-Body Simulations with an FPGA using High-level Synthesis
Tetsu Narumi; Akio Muramatsu
9th International Conference on Pervasive and Embedded Computing and Communication Systems, 65-64, 19 Sep. 2019, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - CUDA offloading for energy‐efficient and high‐frame‐rate simulations using tablets
Edgar Josafat Martinez‐Noriega; Syunji Yazaki; Tetsu Narumi
Concurrency and Computation: Practice and Experience, John Wiley & Sons Ltd, 33, 2, e5488-14, 23 Aug. 2019, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Structural determinants in the bulk heterojunction
Angela Acocella; Siegfried Höfinger; Ernst Haunschmid; Sergiu C. Pop; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Masato Yasui; Francesco Zerbetto
Physical Chemistry Chemical Physics, Royal Society of Chemistry, 20, 8, 5708-5720, 2018, Peer-reviwed
Scientific journal, English - An FPGA-Based Tiled Display System for a Wearable Display
Tetsu Narumi
FIFTH INTERNATIONAL CONFERENCE ON INFORMATICS AND APPLICATIONS (ICIA2016), 12-17, 2016, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Comparison of the Accuracy of Periodic Reaction Field Methods in Molecular Dynamics Simulations of a Model Liquid Crystal System
Nozawa, T; Takahashi, K. Z; Narumi, T; Yasuoka, K
J. Comput. Chem., 36, 2406-2411, 15 Dec. 2015, Peer-reviwed
Scientific journal, English - GPU-accelerated replica exchange molecular simulation on solid-liquid phase transition study of Lennard-Jones fluids
Kentaro Nomura; Minoru Oikawa; Atsushi Kawai; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
MOLECULAR SIMULATION, 41, 10-12, 874-880, Aug. 2015, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Application of isotropic periodic sum method for 4-pentyl-4 '-cyanobiphenyl liquid crystal
Takuma Nozawa; Kazuaki Z. Takahashi; Shun Kameoka; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
MOLECULAR SIMULATION, 41, 10-12, 927-935, Aug. 2015, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Acceleration of the Fast Multipole Method on FPGA Devices
Hitoshi Ukawa; Tetsu Narumi
IEICE TRANSACTIONS ON INFORMATION AND SYSTEMS, E98D, 2, 309-312, Feb. 2015, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Acceleration of Othello Computer Game using an FPGA Tablet
Tomoya Sato; Tetsu Narumi
PROCEEDINGS OF 2015 THIRD INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON COMPUTING AND NETWORKING (CANDAR), WANC2, 581-584, 2015, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - 1,024GPUを使用したレプリカ交換分子動力学シミュレーションの並列化
老川 稔; 野村 昴太郎; 泰岡 顕治; 成見 哲
情報処理学会 コンピューティングシステム, 48, Dec. 2014, Peer-reviwed
Scientific journal, Japanese - Parallel Molecular Dynamics Simulation with Replica-Exchange Method using 1,024 GPUs
Minoru Oikawa; Kentaro Nomura; Kenji Yasuoka; Tetsu Narumi
IPSJ Trans. ACS, Information Processing Society of Japan (IPSJ), 7, 4, 1-14, Dec. 2014, Peer-reviwed, We parallelized a molecular dynamics simulation software using single-node GPUs to support multi-node GPUs by applying GPU virtualization tool to CUDA C/C++ program. To obtain the global minimum state of molecules efficiently, we used replica-exchange method, which is suitable for parallel com- putation since it has large granularity and small communication between nodes. The GPU virtualization software enabled us to use a single-node program to support multi-node calculation without any modification. Parallel efficiency with up to 1,024 GPUs are measured and 87% of efficiency was obtained even with 1,024 GPUs. The main reason of losing efficiency for higher parallelism was quantitatively analyzed and we found it mostly the latency between nodes.
Scientific journal, Japanese - Petascale molecular dynamics simulation using the fast multipole method on K computer
Yousuke Ohno; Rio Yokota; Hiroshi Koyama; Gentaro Morimoto; Aki Hasegawa; Gen Masumoto; Noriaki Okimoto; Yoshinori Hirano; Huda Ibeid; Tetsu Narumi; Makoto Taiji
COMPUTER PHYSICS COMMUNICATIONS, 185, 10, 2575-2585, Oct. 2014, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Petascale turbulence simulation using a highly parallel fast multipole method on GPUs
Rio Yokota; L. A. Barba; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
Computer Physics Communications, 184, 3, 445-455, Mar. 2013, Peer-reviwed
Scientific journal, English - MD simulations on the structure of onco-proteins p53: Wild-type and radioresistant mutant systems
Kholmirzo T. Kholmurodov; Evgenii A. Krasavin; Viktor A. Krylov; Ermuhammad B. Dushanov; Vladimir V. Korenkov; Kenji Yasuoka; Tetsu Narumi; Yousuke Ohno; Makoto Taiji; Toshikazu Ebisuzaki
Molecular Dynamics of Nanobiostructures, Nova Science Publishers, Inc., 179-208, Jan. 2013
In book, English - Common force field thermodynamics of cholesterol
Francesco Giangreco; Eiji Yamamoto; Yoshinori Hirano; Milan Hodoscek; Volker Knecht; Matteo Di Giosia; Matteo Calvaresi; Francesco Zerbetto; Kenji Yasuoka; Tetsu Narumi; Masato Yasui; Siegfried Höfinger
The Scientific World Journal, Hindawi Publishing Corporation, 2013, 1-7, 2013, Peer-reviwed
Scientific journal, English - DS-CUDA: a Middleware to Use Many GPUs in the Cloud Environment
Minoru Oikawa; Atsushi Kawai; Kentaro Nomura; Kazuyuki Yoshikawa; Kenji Yasuoka; Tetsu Narumi
SHPCloud workshop at SC12, 10-16, Nov. 2012, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - GPU-accelerated computation of electron transfer
Siegfried Hoefinger; Angela Acocella; Sergiu C. Pop; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Titus Beu; Francesco Zerbetto
JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY, 33, 29, 2351-2356, Nov. 2012, Peer-reviwed
Scientific journal, English - An Improved Isotropic Periodic Sum Method That Uses Linear Combinations of Basis Potentials
Kazuaki Z. Takahashi; Tetsu Narumi; Donguk Suh; Kenji Yasuoka
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, 8, 11, 4503-4516, Nov. 2012, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Optimization of Molecular Dynamics Core Program on the K computer
Yousuke Ohno; Rio Yokota; Hiroshi Koyama; Gentaro Morimoto, Aki; Hasegawa; Gen Masumoto; Tetsu Narumi; Makoto Taiji
International Conference on Simulation Technology (JSST2012), 1-2, Sep. 2012
International conference proceedings, English - Structural features of aquaporin 4 supporting the formation of arrays and junctions in biomembranes
Siegfried Hoefinger; Eiji Yamamoto; Yoshinori Hirano; Francesco Zerbetto; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Masato Yasui
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES, 1818, 9, 2234-2243, Sep. 2012, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Distributed-Shared CUDA: Virtualization of Large-Scale GPU Systems for Programmability and Reliability
Atsushi Kawai; Kenji Yasuoka; Kazuyuki Yoshikawa; Tetsu Narumi
The Fourth International Conference on Future Computational Technologies and Applications, FUTURE CONPUTING 2012, 22-27, Jul. 2012, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - DS-CUDA: a Middleware to Use Many GPUs in the Cloud Environment
Minoru Oikawa; Atsushi Kawai; Kentaro Nomura; Kenji Yasuoka; Kazuyuki Yoshikawa; Tetsu Narumi
2012 SC COMPANION: HIGH PERFORMANCE COMPUTING, NETWORKING, STORAGE AND ANALYSIS (SCC), 1207-1214, 2012, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Cut-off radius effect of the isotropic periodic sum method for polar molecules in a bulk water system
Kazuaki Takahashi; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
MOLECULAR SIMULATION, 38, 5, 397-403, 2012, Peer-reviwed
Scientific journal, English - A combination of the tree-code and IPS method to simulate large scale systems by molecular dynamics
Kazuaki Z. Takahashi; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 135, 17, 174108, Nov. 2011, Peer-reviwed
Scientific journal, English - FAST QUASI DOUBLE-PRECISION METHOD WITH SINGLE-PRECISION HARDWARE TO ACCELERATE SCIENTIFIC APPLICATIONS
Tetsu Narumi; Tsuyoshi Hamada; Keigo Nitadori; Ryuji Sakamaki; Kenji Yasuoka
INTERNATIONAL JOURNAL OF COMPUTATIONAL METHODS, 8, 3, 561-581, Sep. 2011, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Fast Calculation of Electrostatic Potentials on the GPU or the ASIC MD-GRAPE-3
Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Makoto Taiji; Francesco Zerbetto; Siegfried Hoefinger
COMPUTER JOURNAL, 54, 7, 1181-1187, Jul. 2011, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Cutoff radius effect of the isotropic periodic sum and Wolf method in liquid-vapor interfaces of water
Kazuaki Z. Takahashi; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 134, 17, 174112, May 2011, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Thermodynamic properties of methane/water interface predicted by molecular dynamics simulations
Ryuji Sakamaki; Amadeu K. Sum; Tetsu Narumi; Ryo Ohmura; Kenji Yasuoka
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 134, 14, 144702, Apr. 2011, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Molecular dynamics simulations of vapor/liquid coexistence using the nonpolarizable water models
Ryuji Sakamaki; Amadeu K. Sum; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 134, 12, 124708, Mar. 2011, Peer-reviwed
Scientific journal, English - CUTOFF RADIUS EFFECT OF WATER CONFIGURATION USING THE WOLF METHOD
Kazuaki Takahashi; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
PROCEEDINGS OF THE ASME/JSME 8TH THERMAL ENGINEERING JOINT CONFERENCE 2011, VOL 3, 615-+, 2011, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Accelerating Molecular Dynamics Simulation Using Graphics Processing Unit
Hun Joo Myung; Ryuji Sakamaki; Kwang Jin Oh; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Sik Lee
BULLETIN OF THE KOREAN CHEMICAL SOCIETY, 31, 12, 3639-3643, Dec. 2010, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Cutoff radius effect of the isotropic periodic sum method in homogeneous system. II. Water
Kazuaki Takahashi; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 133, 1, 014109, Jul. 2010, Peer-reviwed
Scientific journal, English - A 281 Tflops Calculation for X-ray Protein Structure Analysis with Special-Purpose Computers MDGRAPE-3
Yousuke Ohno; Eiji Nishibori; Tetsu Narumi; Takahiro Koishi; Tahir H. Tahirov; Hideo Ago; Masashi Miyano; Ryutaro Himeno; Toshikazu Ebisuzaki; Makoto Sakata; Makoto Taiji
2007 ACM/IEEE SC07 CONFERENCE, USB memory, 1-+, 2010, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Current Performance Gains From Utilizing the GPU or the ASIC MDGRAPE-3 Within an Enhanced Poisson Boltzmann Approach
Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Makoto Taiji; Siegfried Hoefinger
JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY, 30, 14, 2351-2357, Nov. 2009, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Fast multipole methods on a cluster of GPUs for the meshless simulation of turbulence
R. Yokota; T. Narumi; R. Sakamaki; S. Kameoka; S. Obi; K. Yasuoka
COMPUTER PHYSICS COMMUNICATIONS, 180, 11, 2066-2078, Nov. 2009, Peer-reviwed
Scientific journal, English - High-Performance Drug Discovery: Computational Screening by Combining Docking and Molecular Dynamics Simulations
Noriaki Okimoto; Noriyuki Futatsugi; Hideyoshi Fuji; Atsushi Suenaga; Gentaro Morimoto; Ryoko Yanai; Yousuke Ohno; Tetsu Narumi; Makoto Taiji
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5, 10, e1000528, Oct. 2009, Peer-reviwed
Scientific journal, English - High-Performance Quasi Double-Precision Method using Single-Precision Hardware for Molecular Dynamics Simulations with GPUs
Tetsu Narumi; Tsuyoshi Hamada; Keigo Nitadori; Ryuji Sakamaki; Shun Kameoka; Kenji Yasuoka
HPC Asia 2009, 160-167, Mar. 2009, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Using Special-Purpose and Video-Game Computers for Accelerating Molecular Dynamics Simulations
Tetsu Narumi; Ryuji Sakamaki; Shun Kameoka; Kenji Yasuoka
MOLECULAR SIMULATION IN MATERIAL AND BIOLOGICAL RESEARCH, 29-40, 2009, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - 42 TFlops Hierarchical N-body Simulations on GPUs with Applications in both Astrophysics and Turbulence
Tsuyoshi Hamada; Rio Yokota; Keigo Nitadori; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Makoto Taiji
PROCEEDINGS OF THE CONFERENCE ON HIGH PERFORMANCE COMPUTING NETWORKING, STORAGE AND ANALYSIS, USB memory, 2009, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - グラフィックカードを用いた水表面張力の高速分子動力学シミュレーション
坂牧隆司; 成見哲; 泰岡顕治
情報処理学会ACS論文誌, 2, 2, 89-97, 2009, Peer-reviwed
Scientific journal, Japanese - JINR CICC in computational chemistry and nanotechnology problems: DL_POLY performance for different communication architectures
E. Dushanov; Kh Kholmurodov; G. Aru; V. Korenkov; W. Smith; Y. Ohno; T. Narumi; G. Morimoto; M. Taiji; K. Yasuoka
Physics of Particles and Nuclei Letters, 6, 3, 251-259, 2009, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Knoppix for CUDA : a CD-bootable GPGPU training environment
HAMADA Tsuyoshi; NARUMI Tetsu; KONISHI Fumikazu; YASUOKA Kenji; OGURI Kiyoshi; SHIBATA Yuichiro; TAIJI Makoto
Journal of the Visualization Society of Japan, 可視化情報学会, 28, 1, 249-254, 01 Jul. 2008
Scientific journal, Japanese - Overheads in Accelerating Molecular Dynamics Simulations with GPUs
Tetsu Narumi; Ryuji Sakamaki; Shun Kameoka; Kenji Yasuoka
PDCAT 2008: NINTH INTERNATIONAL CONFERENCE ON PARALLEL AND DISTRIBUTED COMPUTING, APPLICATIONS AND TECHNOLOGIES, PROCEEDINGS, 143-150, 2008, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Cell size dependence of orientational order of uniaxial liquid crystals in flat slit
Toshiki Mima; Tetsu Narumi; Shun Kameoka; Kenji Yasuoka
MOLECULAR SIMULATION, 34, 8, 761-773, 2008, Peer-reviwed
Scientific journal, English - ACCELERATING MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS ON PLAYSTATION 3 PLATFORM USING VIRTUAL-GRAPE PROGRAMMING MODEL
Tetsu Narumi; Shun Kameoka; Makoto Taiji; Kenji Yasuoka
SIAM JOURNAL ON SCIENTIFIC COMPUTING, 30, 6, 3108-3125, 2008, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Cutoff radius effect of isotropic periodic sum method for transport coefficients of Lennard-Jones liquid
Kazuaki Takahashi; Kenji Yasuoka; Tetsu Narumi
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 127, 11, 114511, Sep. 2007, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Folding dynamics of 10-residue beta-hairpin peptide chignolin
Atsushi Suenaga; Tetsu Narumi; Noriyuki Futatsugi; Ryoko Yanai; Yousuke Ohno; Noriaki Okimoto; Makoto Taiji
CHEMISTRY-AN ASIAN JOURNAL, 2, 5, 591-598, 2007, Peer-reviwed
Scientific journal, English - A 55 Tflops Simulation of Amyloid-forming Peptides from Yeast Prion Sup35 with the Special-Purpose Computer System MDGRAPE-3
Tetsu Narumi; Yousuke Ohno; Noriaki Okimoto; Takahiro Koishi; Atsushi Suenaga; Noriyuki Futatsugi; Yoko Yanai; Ryutaro Himeno; Shigenori Fujikawa; Mitsuru Ikei; Makoto Taiji
SC2006, CDROM, Nov. 2006, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Structure and dynamics of RNA polymerase II elongation complex
A Suenaga; N Okimoto; N Futatsugi; Y Hirano; T Narumi; Y Ohno; R Yanai; T Hirokawa; T Ebisuzaki; A Konagaya; M Taiji
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 343, 1, 90-98, Apr. 2006, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Novel mechanism of interaction of p85 subunit of phosphatidylinositol 3-kinase and ErbB3 receptor-derived phosphotyrosyl peptides
A Suenaga; N Takada; M Hatakeyama; M Ichikawa; XM Yu; K Tomii; N Okimoto; N Futatsugi; T Narumi; M Shirouzu; S Yokoyama; A Konagaya; M Taiji
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 280, 2, 1321-1326, Jan. 2005, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Nanoscale hydrophobic interaction and nanobubble nucleation
T Koishi; S Yoo; K Yasuoka; XC Zeng; T Narumi; R Susukita; A Kawai; H Furusawa; A Suenaga; N Okimoto; N Futatsugi; T Ebisuzaki
PHYSICAL REVIEW LETTERS, 93, 18, 185701-1-4, Oct. 2004, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Simulations of magnetic materials with MDGRAPE-2
BG Elmegreen; RH Koch; ME Schabes; T Crawford; T Ebisuzaki; H Furusawa; T Narumi; R Susukita; K Yasuoka
IBM JOURNAL OF RESEARCH AND DEVELOPMENT, 48, 2, 199-207, Mar. 2004, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Tyr-317 phosphorylation increases shc structural rigidity and reduces coupling of domain motions remote from the phosphorylation site as revealed by molecular dynamics simulations
A Suenaga; AB Kiyatkin; M Hatakeyama; N Futatsugi; N Okimoto; Y Hirano; T Narumi; A Kawai; R Susukita; T Koishi; H Furusawa; K Yasuoka; N Takada; Y Ohno; M Taiji; T Ebisuzaki; JB Hoek; A Konagaya; BN Kholodenko
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 279, 6, 4657-4662, Feb. 2004, Peer-reviwed
Scientific journal, English - 1P053 Proteomic Structural Analysis based on Molecular Dynamics Simulations : Protein-Protein Interactions of Ras-Raf and Ras-RalGDS com
Futatsugi N.; Shirouzu M.; Suenaga A.; Okimoto N.; Narumi T.; Ebisuzaki T.; Yokoyama S.; Taiji M.; Konagaya A.
Seibutsu Butsuri, The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association, 44, S43, 2004
Japanese - MDGRAPE-3: A petaflops special-purpose computer system for molecular dynamics simulations
M Taiji; T Narumi; Y Ohno; A Konagaya
PARALLEL COMPUTING: SOFTWARE TECHNOLOGY, ALGORITHMS, ARCHITECTURES AND APPLICATIONS, 13, 669-676, 2004, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Hardware accelerator for molecular dynamics: MDGRAPE-2
R Susukita; T Ebisuzaki; BG Elmegreen; H Furusawa; K Kato; A Kawai; Y Kobayashi; T Koishi; GD McNiven; T Narumi; K Yasuoka
COMPUTER PHYSICS COMMUNICATIONS, 155, 2, 115-131, Oct. 2003, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Molecular dynamics study on class A beta-lactamase: Hydrogen bond network among the functional groups of penicillin G and side chains of the conserved residues in the active site
Y Fujii; N Okimoto; M Hata; T Narumi; K Yasuoka; R Susukita; A Suenaga; N Futatsugi; T Koishi; H Furusawa; A Kawai; T Ebisuzaki; S Neya; T Hoshino
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 107, 37, 10274-10283, Sep. 2003, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Molecular dynamics, free energy, and SPR analyses of the interactions between the SH2 domain of grb2 and ErbB phosphotyrosyl peptides
A Suenaga; M Hatakeyama; M Ichikawa; XM Yu; N Futatsugi; T Narumi; K Fukui; T Terada; M Taiji; M Shirouzu; S Yokoyama; A Konagaya
BIOCHEMISTRY, 42, 18, 5195-5200, May 2003, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Parallelized Simulation of Molecular Dynamics with a Special-Purpose Computer: MDGRAPE-2
Takada Naoki; Futatsugi Noriyuki; Suenaga Atsushi; Narumi Tetsu; Okimoto Noriaki; Hirano Hidenori; Kawai Atsushi; Yasuoka Kenji; Ebisuzaki Toshikazu; Taiji Makoto; Konagaya Akihiko
GI, Japanese Society for Bioinformatics, 14, 625-626, 2003
English - Protein explorer: A petaflops special-purpose computer system for molecular dynamics simulations
Makoto Taiji; Tetsu Narumi; Yousuke Ohno; Noriyuki Futatsugi; Atsushi Suenaga; Naoki Takada; Akihiko Konagaya
Proceedings of the 2003 ACM/IEEE Conference on Supercomputing, SC 2003, CDROM, 2003, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Molecular Dynamics Simulations of Prion Proteins - Effect of Ala 117→Val Mutation -
Noriaki Okimoto; Kazunori Yamanaka; Atsushi Suenaga; Yoshinori Hirano; Noriyuki Futatsugi; Tetsu Narumi; Kenji Yasuoka; Ryutaro Susukita; Takahiro Koishi; Hideaki Furusawa; Atsushi Kawai; Masayuki Hata; Tyuji Hoshino; Toshikazu Ebisuzaki
Chem-Bio Informatics Journal, 3, 1-11, 2003, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Numerical simulations of magnetic materials with MD-GRAPE: curvature induced anisotropy
BG Elmegreen; R Koch; K Yasuoka; H Furusawa; T Narumi; R Susukita; T Ebisuzaki
JOURNAL OF MAGNETISM AND MAGNETIC MATERIALS, 250, 1-3, 39-48, Sep. 2002, Peer-reviwed
Scientific journal, English - A large scale molecular dynamics simulation for water with special-purpose computer MDM
T Koishi; K Yasuoka; XC Zeng; T Narumi; R Susukita; A Kawai; H Furusawa; T Ebisuzaki
6TH WORLD MULTICONFERENCE ON SYSTEMICS, CYBERNETICS AND INFORMATICS, VOL XVI, PROCEEDINGS, 503-507, 2002, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Molecular dynamics study of the solidification process in alkali halide cluster
T Koishi; K Yasuoka; T Narumi; R Susukita; H Furusawa; T Ebisuzaki
JOURNAL OF NON-CRYSTALLINE SOLIDS, 312-14, 332-336, 2002, Peer-reviwed
Scientific journal, English - An 8.61 Tflop/s Molecular Dynamics Simulation for NaCl with a Special-Purpose Computer: MDM
Tetsu Narumi; Atsushi Kawai; Takahiro Koishi
SC2001, ACM, CDROM, Nov. 2001, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - 1.34 Tflops Molecular Dynamics Simulation for NaCl with a Special-Purpose Computer: MDM
Tetsu Narumi; Ryutaro Susukita; Takahiro Koishi; Kenji Yasuoka; Hideaki Furusawa; Atsushi Kawai; Toshikazu Ebisuzaki
SC2000, CDROM, Nov. 2000, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - 46 Tflops special-purpose computer for molecular dynamics simulations: WINE-2
T Narumi; R Susukita; H Furusawa; T Ebisuzaki
2000 5TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON SIGNAL PROCESSING PROCEEDINGS, VOLS I-III, 1, 575-582, 2000, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - Molecular dynamics machine: Special-purpose computer for molecular dynamics simulations
E Narumi; R Susukita; T Ebisuzaki; G McNiven; B Elmegreen
MOLECULAR SIMULATION, 21, 5-6, 401-415, 1999, Peer-reviwed
Scientific journal, English
MISC
- Fault-Tolerant Molecular Dynamics Simulation using Virtualized GPUs
老川稔; 野村昴太郎; 泰岡顕治; 成見哲
GPU is widely used with many high-performance computing systems as a calculation accelerator. In recent years, the increasing scale and complexity of high-performance computing systems consists of many components causes the shorter MTBF(Mean Time Between Failure) period, so that the fault tolerant methodology are required to achieve the high reliability of the computing systems. We modified the GPU virtualization software to enhance the reliability of GPU computing systems, and tested the fault tolerant functions we implemented by executing molecular dynamics simulation using GPU devices. We supposed two types system fault, (1)calculation error during GPU kernel function, (2)unexpected disconnection between host and GPUs. We achieved the auto recovery functions from these faults, utilizing redundant GPUs, checkpointing and roll-back recovery techniques., Information Processing Society of Japan (IPSJ), 21 Jul. 2014, IPSJ SIG Notes, 2014, 40, 1-6, Japanese, 110009808135, AN10463942 - G134 The electrostatic effect on ordering process of 4-pently-4'-cyanobiphenyl liquid crystal
Nozawa Takuma; Takahashi Kazuaki; Narumi Tetsu; Yasuoka Kenji
Atomic molecular dynamics of bulk liquid crystal state of 4-pentil-4'-cyanobiphenyl (5CB) system were performed. For the coulombic interaction treatment under the periodic boundary conditions, Particle Mesh Ewald (PME) method and Isotropic Periodic Sum (IPS) method were applied. In both cases, the system was ordered from 280K to 290K. However the ordering processes were different between the two cases. When the temperature was fixed to 280K, the result from PME showed layer structure, whereas IPS did not. The mean square displacement of PME drastically changed between 280K and 290K., The Japan Society of Mechanical Engineers, 18 Oct. 2013, Procee[d]ings of Thermal Engineering Conference, 2013, 221-222, Japanese, 110009955702, AA11901963 - CUDA Enabled for Android Tablets through DS-CUDA
EdgarJosafatMartinez-Noriega; Atsushi Kawai; Kazuyuki Yoshikawa; Kenji Yasuoka; Tetsu Narumi
15 May 2013, 先進的計算基盤システムシンポジウム論文集, 2013, 115-116, English, 170000076921 - 4096GPUを用いた4096³規模の一様等方性乱流の渦法解析
横田 理央; Barba Lorena; 成見 哲
東京工業大学学術国際情報センター, Jul. 2012, Tsubame ESJ. : e-science journal, 6, 1-6, Japanese, 2185-6028, 40019415507 - Turbulence Simulation Using 4096³ Vortex Particles on 4096 GPUs
Yokota Rio; Barba Lorena; Narumi Tetsu
東京工業大学学術国際情報センター, Jul. 2012, Tsubame ESJ. : e-science journal, 6, 17-22, English, 2185-6028, 40019415552 - Automatic Redundant Calculation with GPU Virtualization
吉川 和幸; 川井 敦; 泰岡 顕治; 成見 哲
画像処理装置である GPU の高い計算能力を活用する技術である GPGPU が近年普及しつつあり,高性能な画像編集ソフトや動画エンコーディングソフトにも用いられるようになるなど,用途は一般化してきている.しかし,一般の人が使うコンシューマ向け GPU は演算性能的にはサーバー向け GPU に劣らないものの,ECC メモリを搭載しないなど信頼性の面で問題がある.そこで本研究では,GPU 仮想化技術である DS-CUDA を改良して,コンシューマ向け GPU による GPGPU の信頼性を向上させるシステムを開発する.具体的には,複数の GPU で同一の計算をさせる冗長計算を行い,その結果を比較することでいずれかの GPU で計算ミスが発生したことを検出する.計算ミスが発生したら,自動で再計算を行う機能も搭載する.既存のプログラムを変更することなく使用出来ることが最大のメリットである.GPGPU is becoming more and more popular, and recently software for image manipulation or movie encoding also supports GPGPU. However, consumer GPUs for such applications are not so reliable, for example no ECC, even though the performance of them is superior to that of server GPUs. We modified DS-CUDA, which is a framework for GPU virtualization, to enhance the reliability of consumer GPUs. Our system performs redundant calculation with multiple GPUs and checks the difference of the results with each other. When error occurred, the system automatically repeats the former operations on the GPUs. The key is that we do not need any modification of the application software to get the benefit of the reliability., 25 May 2012, 研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング(HPC), 2012, 6, 1-5, Japanese, 110009453400, AN10463942 - Thermodynamic properties of methane/water interface predicted by molecular dynamics simulations (vol 134, 144702, 2011)
Ryuji Sakamaki; Amadeu K. Sum; Tetsu Narumi; Ryo Ohmura; Kenji Yasuoka
Dec. 2011, JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 135, 21, English, Others, 0021-9606, WOS:000298490700044 - Petascale Turbulence Simulation Using FMM
横田 理央; 成見 哲; L.A.Barba; 泰岡 顕治
Fast Multipole Method (FMM) は従来粒子のN体問題の高速化手法として発展してきたが,近年その応用の幅を広げる研究が多くなされている.本研究では,大規模 GPU システム向けに開発された FMM を用いて 20483 規模の乱流解析を行い,同様の計算条件のもとでスペクトル法との比較を行った.ただし,今回の解析に用いた手法は Treecode と FMM の長所を組み合わせたハイブリッド型になっており,GPU 上で高い Flops が出る treecode の特長をさらに高速なアルゴリズムである FMM で実現している.TSUBAME2.0 上で 4096 GPU を用いた計算において 74% の並列化効率を得た.また,このときの演算性能は 1.01PFlops であった.Fast multipole methods (FMM) were originally developed for accelerating N-body problems in astrophysics and other particle based methods. A recent trend in HPC has been to use FMMs in unconventional application areas. We have performed a 20483 turbulence calculation using an FMM designed for large scale GPU systems. The proposed method uses a hybridization of the treecode and FMM, and combines the data-parallel treecode with the O(N) FMM. The run on TSUBAME 2.0 using 4096 GPUs achieved 74 % parallel efficiency, and the sustained performance reached 1.01 PFlops., 21 Nov. 2011, 研究報告計算機アーキテクチャ(ARC), 2011, 29, 1-8, Japanese, 110008713499, AN10096105 - High-Performance Drug Discovery: Computational Screening by Combining Docking and Molecular Dynamics Simulations
Noriaki Okimoto; Noriyuki Futatsugi; Hideyoshi Fuji; Atsushi Suenaga; Gentaro Morimoto; Ryoko Yanai; Yosuske Ohno; Tetsu Narumi; Makoto Taiji
Jan. 2010, BIOPHYSICAL JOURNAL, 98, 3, 460A-460A, English, Summary international conference, 0006-3495, WOS:000208762004306 - Cell size dependence of orientational order of uniaxial liquid crystals in flat slit (vol 34, pg 761, 2008)
Toshiki Mima; Tetsu Narumi; Shun Kameoka; Kenji Yasuoka
2010, MOLECULAR SIMULATION, 36, 3, 254-254, English, Others, 0892-7022, WOS:000274928600011 - 412 Implementation and Evaluation of Particle Mesh Ewald Method on GPU for Molecular Dynamics Simulation
SAKAMAKI Ryuji; NARUMI Tetsu; YASUOKA Kenji
The Japan Society of Mechanical Engineers, 10 Oct. 2009, The Computational Mechanics Conference, 2009, 22, 756-757, Japanese, 1348-026X, 110008702456, AA1190257X - アクセラレータによる粒子法シミュレーションの加速
成見哲; 濱田剛; 小西史一
Feb. 2009, 情報処理, 50, 2, 129-139, Japanese, Introduction other - 618 Large Scale Molecular Dynamics Simulation using GPU
SAKAMAKI Ryuji; NARUMI Tetsu; YASUOKA Kenji
The Japan Society of Mechanical Engineers, 01 Nov. 2008, The Computational Mechanics Conference, 2008, 21, 546-547, Japanese, 1348-026X, 110008701884, AA1190257X - MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION OF WATER INTERFACE
SAKAMAKI Ryuji; NARUMI Tetsu; OHMURA Ryo; YASUOKA Kenji
08 Oct. 2008, Thermophysical properties, 29, 143-145, Japanese, 0911-1743, 10024651215, AN10370091 - D233 分子動力学シミュレーションにおける拡散係数のシステムサイズ依存性(分子動力学1)
亀岡 駿; 美馬 俊喜; 成見 哲; 戎崎 俊一; 泰岡 顕治
Molecular dynamics (MD) is one of the computer simulation methods to observe the microscopic state of materials. It was reported that the diffusion coefficient, which is obtained from MD simulation, increased with the increasing of the system size for 128-2,048 water molecules and 128-1,000 Lennard-Jones (LJ) particles fluid. We have performed the large scale MD simulations to study for the system size effect on the diffusion coefficient. The number of molecules for LJ is 1,000-100,000, and for water is 1,000-50,000. MDGRAPE-3, which is the special purpose computer for molecular dynamics si..., 社団法人日本機械学会, 23 Nov. 2007, 熱工学コンファレンス講演論文集, 2007, 307-308, 110007082989 - 分子動力学シミュレーション専用計算機MDGRAPE-3
成見哲
Apr. 2007, 化学工学, 71, 4, 7-10, Japanese, Introduction other - 遊離型及びリガンド結合型酵素間の構造変化メカニズムの分子動力学的研究
沖本憲明; 中村卓; 二木紀行; 末永敦; 平野秀典; 成見哲; 川井敦; 泰岡顕治; 戎崎俊一
2003, 日本薬学会年会要旨集, 123rd, 3, 0918-9823, 200902226524798999 - 専用計算機MDGRAPE-2を用いた分子動力学シミュレーションの並列化
高田直樹; 二木紀行; 末永敦; 沖本憲明; 平野秀典; 成見哲; 川井敦; 泰岡顕治; 泰地真弘人; 戎崎俊一; 小長谷明彦
2003, 先進的計算基盤システムシンポジウム論文集(SACSIS2003), 197-198 - バイオインフォマティクスのための高性能計算機アーキテクチャ
小長谷明彦; 小西史一; 成見哲
2002, ソフトウェアバイオロジー, 1, 73-77, Japanese, Introduction other - 18pTK-8 NaCl-KCl混合系の結晶成長のシミュレーションIII
古石 貴裕; 泰岡 顕治; 成見 哲; 薄田 竜太郎; 古沢 秀明; 戎崎 俊一
社団法人日本物理学会, 03 Sep. 2001, 日本物理学会講演概要集, 56, 2, 1342-8349, 110002047479 - 29pYH-9 NaCl-KCl混合系の結晶成長のシミュレーション II
古石 貴裕; 泰岡 顕治; 成見 哲; 薄田 竜太郎; 古沢 秀明; 戎崎 俊一
社団法人日本物理学会, 09 Mar. 2001, 日本物理学会講演概要集, 56, 1, 1342-8349, 110002163031 - 分子動力学専用計算機へのAMBERプログラムの移植開発および実用化に向けた性能評価
二木紀行; 沖本憲明; 末永敦; 成見哲; 川井敦; 泰岡顕治; 戎崎俊一
2001, 分子シミュレーション討論会講演要旨集, 14th, 200902198008459297 - 100Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機MDM
成見哲
Nov. 2000, Bit, 11, Japanese, Introduction other - 2000-HPC-82-33 100Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機MDMの開発状況
成見哲; 薄田竜太郎; 古沢秀明; 川井敦; 古石貴裕; 泰岡顕治; 戎崎俊一
我々は現在100Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機Molecular Dynamics Machine(MDM)を開発中である。MDMは、Ewald法を用いたクーロン力および分子間力の計算のために専用に開発される計算機であり、タンパク質を含んだ系のようにクーロン力が支配的で大規模な分子動力学シミュレーションを加速することが出来る。MDMは WINE-2, MDGRAPE-2、ホストコンピュータで構成されており、それぞれクーロン力の波数空間部分、クーロン力の実空間部分および分子間力、結合力その他の計算を行う。2000年末に完成予定であり、現在波数空間部分では29Tflopsの実効速度を得た。, 社団法人情報処理学会, 03 Aug. 2000, 情報処理学会研究報告. [ハイパフォーマンスコンピューティング], 2000, 73, 191-196, 0919-6072, 110002932456 - 22aZC-1 分子動力学専用計算機MDMの性能評価
薄田 竜太郎; 戎崎 俊一; 加藤 健矢; 小林 芳直; 成見 哲; 古沢 秀明; 泰岡 顕治; Elmegreen B.G; McNiven G.D
社団法人日本物理学会, 10 Mar. 2000, 日本物理学会講演概要集, 55, 1, 1342-8349, 110001910686 - 16 分子動力学専用計算機 MDM
泰岡 顕治; 薄田 竜太郎; 戎崎 俊一; 加藤 健矢; 小林 芳直; 成見 哲; 古沢 秀明; Elmegreen B. G; McNiven G. D; 大口 晃司
社団法人日本機械学会, 29 Feb. 2000, 熱流体系および固体系のミクロシミュレーションに関する合同シンポジウム・分子動力学シンポジウム講演論文集, 2000, 5, 31-32, 110002506740
Books and other publications
- Petascale Computing: Algorithm and Applications
Makoto Taiji; Tetsu Narumi; Yousuke Ohno; Edited by David A. Bader
English, Joint work, Petascale Special-Purpose Computer for Molecular Dynamics Simulations, CRC Press, 2008 - 専用計算機によるシミュレーション
成見哲; 杉本大一郎編
Japanese, Joint work, 第10章 照明問題も専用計算機で加速できる, 朝倉書店, 1994
Lectures, oral presentations, etc.
- int8 行列乗算器を活用した倍精度行列積のエミュレーション手法の実装の最 適化
中嶋陸; 内野佑基; 今村俊幸; 成見哲
Poster presentation, Japanese, 日本応用数理学会 若手の会 第10回学生研究発表会
08 Mar. 2025
08 Mar. 2025- 08 Mar. 2025 - VRとAIを用いた言語学支援システム
ブシャダ・イリャス; 渡邊 匡太郎; 成見 哲
Poster presentation, エンタテインメントコンピューティング2024
03 Sep. 2024 - VRを用いたFPGA実験のための遠隔実験システム
中村 俊哉; 近藤 建樹; 成見 哲
Poster presentation, エンタテインメントコンピューティング2024
03 Sep. 2024 - 電気通信大学における情報入試体験会の実施結果概要の報告
小宮常康; 渡辺博芳; 中山泰一; 成見 哲; 山路浩夫
Oral presentation, 情報処理学会第86回全国大会
15 Mar. 2024 - VR技術を用いたダーツにおけるスローイング動作のトレーニングシステムの開発
柴尾 啓太; 濱野 晃暉; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, インタラクション2024
07 Mar. 2024
06 Mar. 2024- 08 Mar. 2024 - スマートフォンで遊ぶマイクロマグネティックシミュレーション
涌井 桐哉; 植田 武; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2022(EC2022), 情報処理学会エンタテインメントコンピューティング研究会, マイクロマグネティクスは原子レベルの磁気の相互作用を取り扱う分野であり,磁気抵抗メモリの開発等に応用されている.シミュレーションにおいては,外部磁界,交換エネルギーによる磁界,静磁界など複数の効果を考慮するため,現象の理解が難しいという問題がある.本研究では,GPU を用いたシミュレーションをスマートフォンで動作させ,加速度センサ等で体を使いながら操作するゲームを開発することで,難解な現象を楽しく学ぶことを目指した., Domestic conference
02 Sep. 2022 - FPGAを用いた12画面タイルドディスプレイシステム
木村 智美; 柴尾 啓太; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2022(EC2022), 情報処理学会エンタテインメントコンピューティング研究会, 本研究では,12 枚のディスプレイを組み合わせて一つの大画面 (約 84 インチ相当) を構成するシステムを開発した.FPGA を用いた専用ハードウェアを開発したため,安価ながら画面間の同期ズレを防ぎティアリングが発生しない.大きなサイズのディスプレイを使わないことから,ばらして持ち運べる,余ったディスプレイを有効活用出来るというメリットもある.実演では,Kinect と組み合わせた大画面VR ゲームのデモを行う., Domestic conference
02 Sep. 2022 - Unity によるマイクロマグネティクスシミュレーションの可視化
李 嘉慶; 成見哲
Oral presentation, Japanese, 情報処理学会第84回全国大会, 東京, マイクロマグネティクスとは、磁石内部に現れる原子磁気モーメントによって作られる磁化構造やその動的な変化を扱う分野であり、ハードディスクのヘッドやMRAMのシミュレーションなどに用いられる。磁気モーメントの相互作用があるため計算量が多くその動きは予測しずらい。本研究では、ゲームエンジンのUnityを用いてマルチプラットフォーム対応のマイクロマグネティクスシミュレーションのリアルタイム可視化システムを開発した。Compute shaderを用いた場合、CUDAより2倍、CPUより約60倍速い。学生はスマートフォンなどのデバイスで手軽にシミュレーションができ、教育用途に役立つ可能性がある。, Domestic conference
04 Mar. 2022 - レイトレーシング法に特化したGPUによる電波伝搬シミュレーションの高速化
荒生太一; 成見哲
Oral presentation, Japanese, 情報処理学会第84回全国大会, 東京, ITS(高度道路交通システム)での車々間・路車間無線通信にはGHz以上の電波が使用され、反射や回折などの影響を強く受ける。複雑な周辺環境に対応するにはレイトレーシング法をベースとしたシミュレーション手法が必要だが計算が膨大になる。一方コンピュータグラフィクスの分野では、専用プロセッサを搭載することでレイトレーシング法の計算を高速に行うGPU(NVIDIA RTX)が普及し始めている。本研究では、レイトレーシング法による電波伝搬シミュレーションをRTXを用いて加速し、従来のイメージング法と計算精度などを比較し実用性を検討した。, Domestic conference
04 Mar. 2022 - FPGAを用いたフィットネスゲームにおけるリアルタイム運動データ記録支援システムの提案
滝川 潤; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第196回システムとLSIの設計技術研究発表会(デザインガイア2021), 情報処理学会, オンライン, Domestic conference
02 Dec. 2021 - 重力多体問題を例とした高位合成ツールの性能比較 ~ SDSoCとVitisの違いに関して ~
村松耀生; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第196回システムとLSIの設計技術研究発表会(デザインガイア2021), 情報処理学会, オンライン, Domestic conference
02 Dec. 2021 - A Report on the Results of Making a Logic Circuit Design Assignment using an FPGA Remotely Accessible
赤池英夫; 島崎俊介; 成見哲
Poster presentation, Japanese, 情報教育シンポジウム(SSS2021)論文集, IPSJ SIG-CE, オンライン, http://id.nii.ac.jp/1001/00212253/, 本研究では,本学学内における対面での利用のみを想定して作成されていた実験システムを,やむを得ない理由で遠隔対応させ使用した結果,教育にどのような影響を及ぼしたかを調査した., Domestic conference
28 Aug. 2021 - FPGAを用いた論理回路設計実験の遠隔実践
赤池 英夫; 島崎 俊介; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 157回研究発表会, 研究報告コンピュータと教育(CE), 情報処理学会 コンピュータと教育研究会, オンライン, Domestic conference
31 Oct. 2020 - 等身大の仮想、手の中のリアル
明石 禎紀; 冨井 陸矢; 真鍋 光希; 高見 太基; 帆山 遼; 羽賀 聡希; 寺崎 葉月; 武井 友里恵; 鈴ヶ嶺 聡哲; 山中 佑紀; 峯水 延浩; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2019(EC2019), 博多, Domestic conference
22 Sep. 2019 - 音源分離を用いた持ち寄りAndroid端末による3Dモデルライブ
杉田 陽亮; 荒生 太一; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2019(EC2019), 博多, Domestic conference
22 Sep. 2019 - FPGAを用いた持ち運び可能なタイルドディスプレイ
白井 暁; 前田 諒磨; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2019(EC2019), Domestic conference
22 Sep. 2019 - 高位合成によるラジオシティ法のソフトウェア/ハードウェア協調FPGAシステム開発
田村昂太郎; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, デザインガイア2018 -VLSI設計の新しい大地-, 情報処理学会, サテライトキャンパスひろしま, Domestic conference
05 Dec. 2018 - 仮想物理世界で歩き回る論理回路
渋谷峻; 成見哲
Poster presentation, Japanese, エンターテインメントコンピューティング2018(EC2018), 情報処理学会エンタテインメントコンピューティング研究会, Domestic conference
14 Sep. 2018 - LeapMotion を用いてVRでイカサマを行える麻雀ゲームの提案
石井拓斗; 成見哲
Poster presentation, Japanese, エンターテインメントコンピューティング2018(EC2018), 情報処理学会エンタテインメントコンピューティング研究会, Domestic conference
14 Sep. 2018 - CG 画像向けの True Color から Deep Color への Inverse Tone Mappingの開発
難波宗介; 成見哲
Oral presentation, Japanese, 情報処理学会第80回全国大会, 東京, Domestic conference
14 Mar. 2018 - FPGAを用いた6画面タイルドディスプレイシステム
岩田拳太郎; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2017(EC2017), 仙台, Domestic conference
16 Sep. 2017 - その場でタイルドディスプレイ
井出 拓弥; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2017(EC2017), Domestic conference
16 Sep. 2017 - 仮想コレクションケースへの展示物配置システム
佐野 明日香; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2017(EC2017), Domestic conference
16 Sep. 2017 - DS-CUDA によるP2P 機能の評価
伊藤一輝; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第15回情報科学技術フォーラム(FIT2016), 富山, Domestic conference
09 Sep. 2016 - FPGA タブレットを用いたDeep Learning アプリケーションの高速化の検討
佐藤知哉; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第15回情報科学技術フォーラム(FIT2016), 富山, Domestic conference
08 Sep. 2016 - CUDA Offloading for Molecular Dynamics Simulation
Martinez-Noriega Edgar Josafat; Tetsu Narumi
Oral presentation, English, 第21回計算工学講演会, (社)日本計算工学会, 新潟コンベンションセンター, Domestic conference
01 Jun. 2016 - PCI Express拡張Boxと仮想GPUとの計算性能比較
瀬戸口幸寿; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 情報処理学会第78回全国大会, 情報処理学会, 横浜, GPUを科学計算などの汎用的な目的で使用する技術はGPGPU(General-Purpose
computing on Graphics Processing Units)として知られている.DS-CUDA(Distributed Shared CUDA)はネットワークを通じたサーバ上のGPUを仮想化するミドルウェアで,クライアント側でソフトを書き換えることなくGPU資源を用いたGPGPUが可能である.ただし,クライアントとサーバー間の通信がボトルネックになり易い.そこで本研究ではMDシミュレーションを題材に,DS-CUDAによる仮想GPUを用いた場合と,物理GPUをPCIExpress拡張Boxを用いて直接扱う場合とで,性能モデルを構築して比較した., Domestic conference
11 Mar. 2016 - DS-CUDA: GPU Virtualization Middleware to Support Migration Functionality
成見 哲; 老川 稔; Martinez-Noriega; EDGAR JOSAFAT; 泰岡 顕治
Oral presentation, Japanese, 第153回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会, 情報処理学会HPC研究会, 松山、愛媛, DS-CUDA is a middleware to virtualize remote GPUs as if they look like local GPUs, by re-
compiling CUDA source code with our compiler. Redundant calculation mechanism of DS-CUDA enables
a fault-tolerant calculation with consumer GPUs, which are not usually so reliable. However, when large
number of GPU nodes are used, the server nodes or network also should have fault-tolerance since large
number of nodes cause more failure. In this research, we added the migration functionality to DS-CUDA,
and evaluated the overhead of it. This function makes the user code continue to run even if server nodes of
GPUs stop. Other implementations using Dynamics Parallelism and GPU Direct RDMA are also explained., Domestic conference
02 Mar. 2016 - 自動車運転技術の乗り心地判定及び運転者への助言を行うAndroidアプリの開発
嶋田 貴行; 難波 宗介; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンターテインメントコンピューティング2015(EC2015), 情報処理学会 エンタテインメントコンピューティング研究会(SIG-EC), 札幌, Domestic conference
26 Sep. 2015 - Mixed Reality空間における仮想書斎システムの開発
大和田 瑛美華; 佐藤 知哉; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンターテインメントコンピューティング2015(EC2015), 情報処理学会 エンタテインメントコンピューティング研究会(SIG-EC), 札幌, Domestic conference
26 Sep. 2015 - 数十枚のGPUを手軽に使えるGPU仮想化ツール:DS-CUDA
成見 哲
Invited oral presentation, Japanese, GPU Technology Conference Japan, Invited, GPUコンピューティング研究会, GPUエヌビディア合同会社, 虎ノ門, 東京, CUDAが普及して一枚のGPUを使うコードを書ける人が増えてきたものの、数十枚 のGPUを使いたい場合はMPIによる並列化やマシンの管理などの問題がありまだま だ敷居が高い。我々はGPUを仮想化するツールDS-CUDAを提供しており、比較的簡 単に数十枚のGPUを使ったり、故障したGPUを自動的に切り替えたり出来る。本講 演では例を交えながらツールの概要を紹介する。, Domestic conference
18 Sep. 2015 - High Performance Computing on Mobile Devices through Distributed Shared CUDA
Edgar Josafat; Martinez Noriega
Oral presentation, English, GPU Technology Conference, San Jose, Through a GPU virtualization tool, (DS-CUDA), we remotely use an NVIDIA GPU from our local network to accelerate a molecular dynamics (MD) simulation inside an Android device (NVIDIA SHIELD™). We implement a NaCl MD simulation on Android. We accelerate the computation of force, velocity and coordinate using CUDA through the DS-CUDA tool. We use a laptop equipped with GeForce GTX 680M (server) connected to our LAN network using Gigabit Ethernet. Android device (client) is connected to same LAN using Wifi 802.11n. Server and client communicate under tcp socket. We reached up to 420 Gflops in force computation on a simulation with 5832 ions, 5700 times faster than the 0.073 Gflops delivered from CPU implementation on NVIDIA SHIELD™., International conference
18 Mar. 2015 - Unityアプリケーションのクラウド化による高速化
高橋 悠; 伊藤 一輝; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第148回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会, 別府, Domestic conference
03 Mar. 2015 - FPGAタブレットによるモバイルアクセラレータ
塩谷 丈史; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第148回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会, 別府, Domestic conference
02 Mar. 2015 - Making Logic Circuits with a Single Component in a Virtual Kinematic Environment
Tetsu Narumi
Poster presentation, English, Chem-Bio Informatics Society(CBI) Annual Meeting 2014, 情報計算化学生物(CBI)学会, タワーホール船堀、東京, Domestic conference
28 Oct. 2014 - マルチGPUの活用を簡単にする仮想化技術
成見 哲
Keynote oral presentation, Japanese, Prometech Simulation Conference 2014, GPU Computing Workshop for Advanced Manufacturing, プロメテック・ソフトウェア株式会社, 東京, Domestic conference
26 Sep. 2014 - FPGAを用いた3Dタイルドディスプレイシステム
堀田 将也; 嶋田 貴行; 大和田 瑛美華; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第19回日本バーチャルリアリティ学会大会, 名古屋, Domestic conference
17 Sep. 2014 - Android向けUnityアプリの仮想化
高橋 悠; 成見 哲
Poster presentation, Japanese, エンタテインメントコンピューティング2014(EC2014), 中野, Domestic conference
13 Sep. 2014 - AndroidアプリからのFPGAの利用による処理の高速化
塩谷丈史; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第13回情報科学フォーラム(FIT2014), 筑波, Domestic conference
05 Sep. 2014 - 仮想物理世界で動く大規模論理回路の実現のための立方体型ゲートの提案
神澤 俊; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第13回情報科学技術フォーラム(FIT2014), 筑波, Domestic conference
03 Sep. 2014 - GPU 仮想化による耐故障性を考慮した分子動力学シミュレーション
老川稔; 野村昴太郎; 泰岡顕治; 成見哲
Oral presentation, Japanese, 2014 年並列/分散/協調処理に関するサマー・ワークショップ(SWoPP2014), 情報処理学会ハイパフォーマンスコンピューティング研究会, 新潟, Domestic conference
30 Jul. 2014 - Logic gates in kinematic virtual environment
Yukitoshi Setoguchi; Tetsu Narumi
Poster presentation, Japanese, 2014年度人工知能学会全国大会(第28回), 人工知能学会, 松山, Each individual piece of arti cial life (ALife) is usually controlled by the AI, which is programmed by the
scientist. Therefore, we couldn't say the piece lives completely in the virtual environment. We propose ALife which
works within the kinematic virtual environment including the program itself. As a rst step of it, logical units
in the kinematic environment are implemented using Unity, a game constructing tool with kinematic engine. A
ring oscillator works faster than the previous one which was made by PhysX, a lower-level kinematic engine. A
comparison of the speed of a simple particle-collision calculation between Unity and CUDA, a lowest-level engine
with graphics processing unit, showed that CUDA is much faster than Unity for simple calculation. Also a simpler
NAND gate is proposed to build complicated logical units easier., Domestic conference
14 May 2014 - モバイルタイルドディスプレイの開発
安枝 光; 堀田将也; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 情報処理学会第76回全国大会, 情報処理学会, 東京, Domestic conference
11 Mar. 2014 - Running CUDA on Android Through GPU Virtualization
Edgar Josafat; Martinez Noriega
Poster presentation, English, GPU Technology Conference, NVIDIA, San Jose, USA, The way we interact with computers has been modified since tablets and smartphones had come into daily life scene. These new smart and interactive devices offer a new way to represent data and interact with it taking input from different sources. Nowadays, they are equipped with multicore processors on its CPU and also integrate GPU, however they are still lack of libraries for multicore computing such as CUDA (Compute Unified Device Architecture) or OpenCL. On this work we propose the usage of DS-CUDA, a middleware that allows you to manage NVIDIA's GPUs on a distributed network, to run CUDA code on Android devices., International conference
Mar. 2014 - 対話型アプリケーション向けハンズフリー入力装置の開発
椨木 正博; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, ENTERTAINMENT COMPUTING 2013,ENTERTAINMENT COMPUTING 2013
Oct. 2013 - モバイルタイルドディスプレイの開発
安枝 光; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, ENTERTAINMENT COMPUTING 2013,ENTERTAINMENT COMPUTING 2013
Oct. 2013 - 国会答弁の言語特徴量と印象の相関調査
御崎 淳; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第12回情報科学技術フォーラム(FIT2013),第12回情報科学技術フォーラム(FIT2013)
Sep. 2013 - 拡張現実感を用いた 3D モデリングシステムの開発
春田英和; 成見哲
Oral presentation, Japanese, 映像情報メディア学会2013年次大会,映像情報メディア学会2013年次大会
Aug. 2013 - GPUによる大規模シミュレーションと支援ツール
成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第339回CBI学会研究講演会,第339回CBI学会研究講演会
Jun. 2013 - 256GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化
老川 稔; 野村 昴太郎; 川井 敦; 泰岡 顕治; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 第18回計算工学講演会,第18回計算工学講演会
Jun. 2013 - CUDA Enabled for Android Tablets through DS-CUDA
Edgar Josafat Martinez-Noriega; Atsushi Kawai; Kazuyuki Yoshikawa; Kenji Yasuoka; Tetsu Narumi
Oral presentation, Japanese, 先進的計算基盤システムシンポジウムSACSIS 2013,先進的計算基盤システムシンポジウムSACSIS 2013
May 2013 - DS-CUDAを用いたGPGPUの信頼性向上システム
吉川 和幸; Edgar Josafat Martinez-Noriega; 川井 敦; 泰岡 顕治; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 先進的計算基盤システムシンポジウムSACSIS2013,先進的計算基盤システムシンポジウムSACSIS2013
May 2013 - GPUによる大規模分子動力学シミュレーション
成見 哲
Oral presentation, Japanese, 高分子計算機科学研究会,高分子計算機科学研究会「大規模計算機シミュレーションが拓く高分子研究の新展開」
Mar. 2013 - 剛体水モデルにおける水/氷共存状態の分子動力学シミュレーション
高岩大輔; 坂牧隆司; Amadeu K. Sum; 成見哲; 泰岡顕治
Oral presentation, Japanese, 第26回分子シミュレーション討論会
Nov. 2012 - 剛体水モデルにおける水/氷共存状態の分子動力学シミュレーション
高岩大輔; 坂牧隆司; Amadeu K. Sum; 成見哲; 泰岡顕治
Oral presentation, Japanese, 第26回分子シミュレーション討論会
Nov. 2012 - GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化
野村昴太郎; 老川稔; 川井敦; 成見哲; 泰岡顕治
Oral presentation, Japanese, 第26回分子シミュレーション討論会,第26回分子シミュレーション討論会
Nov. 2012 - GPU仮想化による自動冗長計算システム
吉川和幸; 川井敦; 泰岡顕治; 成見哲
Oral presentation, Japanese, 第134回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会,第134回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会
Jun. 2012 - 高性能計算を用いた人工生命の研究
原 健一郎; 成見 哲
Oral presentation, Japanese, 2012年度人工知能学会全国大会(第26回),2012年度人工知能学会全国大会(第26回)
Jun. 2012 - GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化
野村昴太郎; 坂牧隆司; 成見哲; 泰岡顕治
Oral presentation, Japanese, 第17回計算工学講演会,第17回計算工学講演会
May 2012 - 大規模GPUとFMMを用いた一様等方性乱流の解析
成見哲; 横田理央; Barba Lorena; 泰岡顕治
Oral presentation, Japanese, 第19回ハイパフォーマンスコンピューティングとアーキテクチャの評価に関する北海道ワークショップ
Nov. 2011 - 並列GPUによるN体問題の加速
成見哲
Oral presentation, Japanese, 第3回アクセラレーション技術発表討論会
Sep. 2011 - GPGPUによるモンテカルロ碁のシミュレーションの並列処理
岩川 夏季; 成見哲; 村松正和
Oral presentation, Japanese, 第26回ゲーム情報学研究会,第26回ゲーム情報学研究会
Jul. 2011 - What the GPU Computing Technology Can or Cannot in the Near Future
Tetsu Narumi
Keynote oral presentation, English, Mini Symposium on Computational mechanics on GPUs and modern many-core processors in the 9th World Congress on Computational Mechanics (WCCM) and 4th Asian Pacific Congress on Computational Mechanics (APACOM), IACM (International Association for Computational Mechanics) APACM (Asian Pacific Association for Computational Mechanics), Sydney, Australia, International conference
Jul. 2010 - Achieving Enough Accuracy without Double-Precision Hardware to Accelerate Molecular Dynamics Simulations with GPUs
Tetsu Narumi
Invited oral presentation, English, 2nd International Workshop on Advances in Computational Mechanics (IWACOM-II), 日本計算工学会,日本機械学会(計算力学部門),横浜国立大学, Yokohama, Japan, International conference
Mar. 2010 - 分子動力学シミュレーションにおけるParticle Mesh Ewald法のGPUへの実装と評価
坂牧隆司; 成見哲; 泰岡顕治
Oral presentation, Japanese, 第22回計算力学講演会
Oct. 2009 - 水/メタン気液界面の分子動力学シミュレーション
坂牧隆司; 成見哲; 大村亮; 泰岡顕治
Public symposium, Japanese, 第46回日本伝熱シンポジウム, 第46回日本伝熱シンポジウム, 京都
Jun. 2009 - Isotropic Periodic Sum法およびWolf法を用いたMDシミュレーション
高橋和義; 成見哲; 泰岡顕治
Public symposium, Japanese, 第46回日本伝熱シンポジウム, 第46回日本伝熱シンポジウム, 京都
Jun. 2009 - 分子動力学シミュレーションのGPUによる高速化
成見哲; 坂牧隆司; 泰岡顕治
Oral presentation, Japanese, 第14回計算工学講演会
May 2009 - Using Special-Purpose and Video-Game Computers for Accelerating Molecular Dynamics Simulations
Testu Narumi; Ryuji Sakamaki; Shun Kameoka; Kenji Yasuoka
Invited oral presentation, English, International Workshop on Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences, Joint Institute for Nuclear Research, Rusia, Dubna, Russia, International conference
Sep. 2008 - Special-Purpose Computers and Video-Game Consoles as a High Performance Computing Platform for Molecular Dynamics Simulation
Tetsu Narumi; Ryuji Sakamaki; Shun Kameoka; Makoto Taiji; Kenji Yasuoka
Invited oral presentation, English, ICCSE2007 at the 9th High Performance Computing International Conference & Exhibition, ICCSE2007 at the 9th High Performance Computing International Conference & Exhibition, Seoul, Korea, International conference
Sep. 2007 - Accelerating Molecular Dynamics Simulations by Special-Purpose Computers and Game Consoles
Tetsu Narumi; Toshikazu Ebisuzaki; Makoto Taiji; Kenji Yasuoka
Invited oral presentation, English, CALCON2007 (62nd Calorimetry Conference), CALCON2007 (62nd Calorimetry Conference), Hawaii, USA, International conference
Aug. 2007 - A High-Speed Special-Purpose Computer for Molecular Dynamics Simulations : MDGRAPE-3
Tetsu Narumi; Yousuke Ohno; Noriyuki Futatsugi; Noriaki Okimoto; Atsushi Suenaga; Ryoko Yanai; Makoto Taiji
Invited oral presentation, English, NIC Workshop : From Computational Biophysics to Systems Biology 2006, NIC Series, John von Neumann Institute for Computing, Germany, Julich, Germany, International conference
Jun. 2006
Courses
- コンピュータサイエンス実験第一
The University of Electro-Communications - コンピュータサイエンス実験第一
The University of Electro-Communications - コンピュータサイエンス実験第一
電気通信大学 - コンピュータサイエンス実験第二A,B
The University of Electro-Communications - Computer Graphics
The University of Electro-Communications - コンピュータグラフィックス
電気通信大学 - Advanced High Performance Computing
The University of Electro-Communications - 総合コミュニケーション科学
The University of Electro-Communications - コンピュータサイエンス実験第二A,B
The University of Electro-Communications - コンピュータサイエンス実験第二A,B
電気通信大学 - ハイパフォーマンスコンピューティング特論
The University of Electro-Communications - 総合コミュニケーション科学
The University of Electro-Communications - 総合コミュニケーション科学
電気通信大学 - イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン2
The University of Electro-Communications - イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン2
電気通信大学 - イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン1
The University of Electro-Communications - イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン1
電気通信大学 - コンピュータサイエンス実験第二
The University of Electro-Communications - 計算機工学
The University of Electro-Communications - コンピュータ設計論
The University of Electro-Communications - エンジニアリングデザイン2
The University of Electro-Communications - 情報工学工房
The University of Electro-Communications - 大学院技術英語
The University of Electro-Communications - エンジニアリングデザイン1
The University of Electro-Communications - コンピュータサイエンス実験第二
The University of Electro-Communications - コンピュータサイエンス実験第二
電気通信大学 - 情報工学工房
The University of Electro-Communications - 情報工学工房
電気通信大学 - 大学院技術英語
The University of Electro-Communications - 大学院技術英語
電気通信大学 - コンピュータ設計論
The University of Electro-Communications - コンピュータ設計論
電気通信大学 - 計算機工学
The University of Electro-Communications - 計算機工学
電気通信大学 - エンジニアリングデザイン2
The University of Electro-Communications - エンジニアリングデザイン2
電気通信大学 - エンジニアリングデザイン1
The University of Electro-Communications - エンジニアリングデザイン1
電気通信大学 - ハイパフォーマンスコンピューティング特論
The University of Electro-Communications - ハイパフォーマンスコンピューティング特論
電気通信大学
Research Themes
- タイルドディスプレイを用いた汎用的ウェアラブルディスプレイの開発
成見哲
Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research, The University of Electro-Communications, Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Principal investigator, 当研究では、タイルドディスプレイを用いて服のように着られるディスプレイを開発する。 ディスプレイを格子状に多数並べるタイルドディスプレイは、高解像度の大画面を安価に実現 出来るためデジタルサイネージ等で使われている。スマートフォンを並べてソフトウェアで制御 する手法もあるが、動画再生時にティアリングが発生する。本課題では、複数台のタブレット用 小型ディスプレイをFPGA ハードウェアで制御することにより、ティアリングが発生せずベストの 様に被って使えるウェアラブルディスプレイを安価に実現するところが特徴である。, 17K00267
01 Apr. 2017 - 31 Mar. 2020 - Large tiled display system with virtualized GPU
Narumi Tetsu
Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C), The University of Electro-Communications, Grant-in-Aid for Scientific Research (C), We developed a cost-effective tiled display system by designing a custom FPGA board instead of using professional equipments. Since it is composed by a hardware, tearing cannot be happen. Actually, we made sure that the timing difference between displays are very small because it worked with stereo display using shutter glasses which is very sensitive to synchronization of displays. Also we developed a software to support remote OpenGL rendering by extending DS-CUDA middleware which virtualizes remote GPUs., 24500108
01 Apr. 2012 - 31 Mar. 2016 - 仮想物理世界における大規模論理回路の実現
成見 哲
日本学術振興会, 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型), 電気通信大学, 新学術領域研究(研究領域提案型), 本研究の目的は、分子ロボットに不可欠な大規模論理回路の実現に先立って、コンピュータ内の仮想的な物理世界において大規模な論理回路を実現する手法を確立することである。平成26年度は仮想GPU技術を用いて大規模な論理回路を実装する予定であったが、ロボットに必要ないくつかの機能の確認に留まった。 平成25年度にはゲームエンジンであるUnityを用いて機械式論理回路を設計することで立方体型NANDゲートを作成した。しかし配線できない回路が存在することが分かり、平成26年度は立方体式AND/NANDゲートを作成することで、どのような論理回路も設計できる基本部分を作ることが出来た。これを用いてリングオシレータを実装したところ、立方体型NANDゲートよりも若干低速ながら、同等の速度を達成することが出来た。 また、より複雑で生物のように動く回路を作るために、リングオシレータに脚パーツをつなぐことで、歩く論理回路を作成した。分子ロボットに不可欠な「センサー」「モーター」「コンピュータ」「構造」の4要素のうち、「モーター」と「コンピュータ」を備えたものを作り出せたことから、仮想物理世界で論理回路を作る意義を確認出来た。 ただしGPUを用いた大規模化は実現出来なかった。Unityがベースとしている物理エンジンのPhysXはGPUで加速可能と謳われているが、実際には剛体モデルではGPUの加速は実装されていなかったことが大きい。また、Unityでは剛体同士の微妙な遊びを調整するなど職人的な設計が必要となり、性能を出すためのネックとなることが分かった。今後はより単純化した物理モデルを用いてCUDAなどのより低レベルの言語を用いてGPUでの加速を実装するなど、方針を変える必要があることが分かった。, 25104509
01 Apr. 2013 - 31 Mar. 2015 - Development of Enhanced GRAPE library for Quasi general-purpose Computer
NARUMI Tetsu
Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B), Keio University, Grant-in-Aid for Young Scientists (B), I have extended a library program from MDGRAPE special-purpose computer to quasi general-purpose computer (PLAYSTATION 3 and GPU) for molecular dynamics and turbulence simulations with vortex method. First, new MR3 library, which is the library program for MDGRAPE-3, has supported PS3 and GPU. Second, Parallel PS3s further accelerated MD simulations for large number of particles. Third, parallel GPUs further accelerated turbulence simulations with the vortex method., 20700031
2008 - 2009