
GEN-ICHI SAMPEI
Department of Engineering Science | Professor |
Cluster III (Fundamental Science and Engineering) | Professor |
- Profile:
1983-1990 Structure and function relationships of purine nucleotide biosynthetic genes in E. coli
1988-1996 Regulation of gene expresion of purine nucleotide biosynthetic genes in E. coli
1994-1997 Genome analysis of E. coli
1996- Organization and diversification of plasmid genomes
1997- Organization of purine nucleotide biosynthetic genes of E. coli
2001- X-ray crystallography of the enzymes of purine nucleotide biosynthetic pathway in Thermus thermophilus
2002- Regulation of gene expresion of purine nucleotide biosynthetic genes in Thermus thermophilus
2002- Regulation of gene expresion of tryptophan biosynthetic genes in Thermus thermophilus
Researcher Information
Research Keyword
Field Of Study
Career
Educational Background
- 31 Mar. 1990
The University of Tokyo, Graduate School, Division of Science, 生物化学専攻 - 15 Jun. 1989
The University of Tokyo, Graduate School, Division of Science, 生物化学専攻 - 31 Mar. 1986
The University of Tokyo, Graduate School, Division of Science, 生物化学専攻 - 31 Mar. 1984
The University of Tokyo, Faculty of Science, 生物化学科 - 31 Mar. 1979
福島県立安積高等学校, 普通科
Research Activity Information
Paper
- Crystal structure of guanosine 5'-monophosphate synthetase from the thermophilic bacterium Thermus thermophilus HB8.
Naoki Nemoto; Seiki Baba; Gota Kawai; Gen Ichi Sampei
Corresponding, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications, 01 Oct. 2024, Peer-reviwed, True, Guanosine 5'-monophosphate (GMP) synthetase (GuaA) catalyzes the last step of GMP synthesis in the purine nucleotide biosynthetic pathway. This enzyme catalyzes a reaction in which xanthine 5'-monophosphate (XMP) is converted to GMP in the presence of Gln and ATP through an adenyl-XMP intermediate. A structure of an XMP-bound form of GuaA from the domain Bacteria has not yet been determined. In this study, the crystal structure of an XMP-bound form of GuaA from the thermophilic bacterium Thermus thermophilus HB8 (TtGuaA) was determined at a resolution of 2.20 Å and that of an apo form of TtGuaA was determined at 2.10 Å resolution. TtGuaA forms a homodimer, and the monomer is composed of three domains, which is a typical structure for GuaA. Disordered regions in the crystal structure were obtained from the AlphaFold2-predicted model structure, and a model with substrates (Gln, XMP and ATP) was constructed for molecular-dynamics (MD) simulations. The structural fluctuations of the TtGuaA dimer as well as the interactions between the active-site residues were analyzed by MD simulations.
Scientific journal, English - Crystal structure of adenylosuccinate lyase from the thermophilic bacterium Thermus thermophilus HB8.
Naoki Nemoto; Gota Kawai; Gen Ichi Sampei
Corresponding, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications, 01 Nov. 2023, Peer-reviwed, True, Adenylosuccinate lyase (PurB) catalyzes two distinct reactions in the purine nucleotide biosynthetic pathway using the same active site. The ability to recognize two different sets of substrates is of structural and evolutionary interest. In the present study, the crystal structure of PurB from the thermophilic bacterium Thermus thermophilus HB8 (TtPurB) was determined at a resolution of 2.38 Å by molecular replacement using a structure predicted by AlphaFold2 as a template. The asymmetric unit of the TtPurB crystal contained two TtPurB molecules, and some regions were disordered in the crystal structure. The disordered regions were the substrate-binding site and domain 3. TtPurB forms a homotetramer and the monomer is composed of three domains (domains 1, 2 and 3), which is a typical structure for the aspartase/fumarase superfamily. Molecular dynamics simulations with and without substrate/product were performed using a full-length model of TtPurB which was obtained before deletion of the disordered regions. The substrates and products were bound to the model structures during the MD simulations. The fluctuations of amino-acid residues were greater in the disordered regions and became smaller upon the binding of substrate or product. These results demonstrate that the full-length model obtained using AlphaFold2 can be used to generate the coordinates of disordered regions within the crystal structure.
Scientific journal, English - Convergent evolution of nitrogen-adding enzymes in the purine nucleotide biosynthetic pathway, based on structural analysis of adenylosuccinate synthetase (PurA).
Gen-Ichi Sampei; Hironori Ishii; Hiroyuki Taka; Gota Kawai
Lead, The Journal of general and applied microbiology, 10 Jun. 2023, Peer-reviwed, False, Adenylosuccinate synthetase (PurA) is an enzyme responsible for the nitrogen addition to inosine monophosphate (IMP) by aspartate in the purine nucleotide biosynthetic pathway. And after which the fumarate is removed by adenylosuccinate lyase (PurB), leaving an amino group. There are two other enzymes that catalyze aspartate addition reactions similar to PurA, one in the purine nucleotide biosynthetic pathway (SAICAR synthetase, PurC) and the other in the arginine biosynthetic pathway (argininosuccinate sythetase, ArgG). To investigate the origin of these nitrogen-adding enzymes, PurA from Thermus thermophilus HB8 (TtPurA) was purified and crystallized, and crystal structure complexed with IMP was determined with a resolution of 2.10 Å. TtPurA has a homodimeric structure, and at the dimer interface, Arg135 of one subunit interacts with the IMP bound to the other subunit, suggesting that IMP binding contributes to dimer stability. The different conformation of His41 side chain in TtPurA and EcPurA suggests that side chain flipping of the His41might play an important role in orienting γ-phosphate of GTP close to oxygen at position 6 of IMP, to receive the nucleophilic attack. Moreover, through comparison of the three-dimensional structures and active sites of PurA, PurC, and ArgG, it was suggested that the active sites of PurA and PurC converged to similar structures for performing similar reactions.
Scientific journal, English - Non-coding RNAs and functional RNA elements in Thermus thermophilus.
Gota Kawai; Gen-Ichi Sampei; Makoto Nishiyama; Yoshitaka Bessho
The Journal of general and applied microbiology, 02 Jun. 2023, Peer-reviwed, False, To complete the ThermusQ database, small non-coding RNAs (ncRNAs) and functional RNA elements found Thermus thermophilus were summarized with annotations. The well-known three ncRNAs, M1 RNA, tmRNA and SRP RNA, were annotated as ttj8_nc001 to ttj8_nc003, and 10 novel RNAs were annotated as ttj8_nc004 to ttj8_nc013. Antisense RNAs for some ORFs were annotated as ttj8_EST00001 to ttj8_EST00006. In addition, a set of conserved sequences found in T. thermophilus HB27 were also described.
Scientific journal, English - Free-Energy Profile Analysis of the Catalytic Reaction of Glycinamide Ribonucleotide Synthetase
Norifumi Yamamoto; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Life, MDPI, 12, 281, Feb. 2022, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Crystal structure of adenylate kinase from an extremophilic archaeon Aeropyrum pernix with ATP and AMP
Yoshinori Shibanuma; Naoki Nemoto; Norifumi Yamamoto; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
J Biochem., 168, 3, 223-229, 13 May 2020, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Crystal Structure of Flavin Dependent Thymidylate Synthase, Thy1, from Thermus thermophilus having an Extra C Terminal Domain
Aoba Ogawa; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun., 75, 450-454, Jun. 2019, Peer-reviwed
Scientific journal, English - RNomics of Thermus thermophilus HB8 by DNA microarray and next-generation sequencing
Gota Kawai; Yuri Aoki; Maina Otsu; Naomi Koike; Gen-ichi Sampei
Corresponding, J Biochem., 162, 6, 423-430, Nov. 2017, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Crystal structures of a subunit of the formylglycinamide ribonucleotide amidotransferase, PurS, from Thermus thermophilus, Sulfolobus tokodaii and Methanocaldococcus jannaschii
Yuzo Watanabe; Hisaaki Yanai; Mayumi Kanagawa; Sakiko Suzuki; Satoko Tamura; Kiyoshi Okada; Seiki Baba; Takashi Kumasaka; Yoshihiro Agari; Lirong Chen; Zheng-Qing Fu; John Chrzas; Bi-Cheng Wang; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Ryoji Masui; Seiki Kuramitsu; Shigeyuki Yokoyama; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, 72, 627-635, Aug. 2016, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Crystal structures and ligand binding of PurM proteins from Thermus thermophilus and Geobacillus kaustophilus
Mayumi Kanagawa; Seiki Baba; Yuzo Watanabe; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Seiki Kuramitsu; Shigeyuki Yokoyama; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 159, 3, 313-321, Mar. 2016, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Structures and reaction mechanisms of the two related enzymes, PurN and PurU
Gen-ichi Sampei; Mayumi Kanagawa; Seiki Baba; Toshiaki Shimasaki; Hiroyuki Taka; Shohei Mitsui; Shinji Fujiwara; Yuki Yanagida; Mayumi Kusano; Sakiko Suzuki; Kayoko Terao; Hiroya Kawai; Yoko Fukai; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Seiki Kuramitsu; Shigeyuki Yokoyama; Gota Kawai
Lead, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 154, 6, 569-579, Dec. 2013, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Structure of N-formylglycinamide ribonucleotide amidotransferase II (PurL) from Thermus thermophilus HB8
Sakiko Suzuki; Hisaaki Yanai; Mayumi Kanagawa; Satoko Tamura; Yuzo Watanabe; Kyotaro Fuse; Seiki Baba; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, 68, 14-19, Jan. 2012, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Dissecting enzyme mechanisms in the purine nucleotides biosynthetic pathway
Gota Kawai; Seiki Baba; Mayumi Kanagawa; Seiki Kuramitsu; Gen-ichi Sampei
Acta Crystallography, A76, C782, Aug. 2011
International conference proceedings, English - Crystal structures of glycinamide ribonucleotide synthetase, PurD, from thermophilic eubacteria
Gen-ichi Sampei; Seiki Baba; Mayumi Kanagawa; Hisaaki Yanai; Takeshi Ishii; Hiroya Kawai; Yoko Fukai; Akio Ebihara; Noriko Nakagawa; Gota Kawai
Lead, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 148, 4, 429-438, Oct. 2010, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Structures of hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase (TTHA0220) from Thermus thermophilus HB8.
Kanagawa M; Baba S; Ebihara A; Shinkai A; Hirotsu K; Mega R; Kim K; Kuramitsu S; Sampei G; Kawai G
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun., 66, 893-898, Jul. 2010, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Complete genome sequence of the incompatibility group I1 plasmid R64
Gen-ichi Sampei; Nobuhisa Furuya; Keiko Tachibana; Yasuhiro Saitou; Takuji Suzuki; Kiyoshi Mizobuchi; Teruya Komano
Lead, Plasmid, 64, 92-103, Jun. 2010, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Structural genomics on the purine nucleotides biosynthetic pathway
Sampei G; iv. of Electro-Communications; Baba S.(RIKEN SPring; Center),Kanagawa M; RIKEN SPring; Center),Nakagawa; N; RIKEN SPring; Center),Ebihara A; RIKEN SPring; Center),Kuramitsu S; RIKEN SPring; Center),Kawai; G.(Chiba; Institute of Technology
Acta Crystallographica Section A, The International Union of Crystallography, 64, 64, C264-C264, 28 Aug. 2008
International conference proceedings, English - Hierarchical Alignment of RNA Secondary Structures Including Pseudonots
Shinnosuke Seki; Atsushi Kijima; Satoshi Kobayashi; Gen-ichi Sampei
Proc. of Genome Informatics Workshop, 117, 2004, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - The plasmid F OmpP protease, a homologue of OmpT, as a potential obstacle to E-coli-based protein production
E Matsuo; G Sampei; K Mizobuchi; K Ito
FEBS LETTERS, 461, 1-2, 6-8, Nov. 1999, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Organization and diversification of genomes of IncF and IncI plasmids by shuffling of functional modules.
Kiyoshi Mizobuchi; Gen-ichi Sampei
The International Symposium of Frontier of the Genome Biology of Escherichia coli(Okazaki), 7, Nov. 1998
International conference proceedings, English - Construction of a contiguous 874-kb sequence of the Escherichia coli -K12 genome corresponding to 50.0-68.8 min on the linkage map and analysis of its sequence features
Yoshihiro Yamamoto; Hiroji Aiba; Tomoya Baba; Kouji Hayashi; Toshifumi Inada; Katumi Isono; Takeshi Itoh; Sigenobu Kimura; Masanari Kitagawa; Kozo Makino; Takeyoshi Miki; Nobutaka Mitsuhashi; Kiyoshi Mizobuchi; Hirotada Mori; Shinsuke Nakade; Yoshikazu Nakamura; Hiroko Nashimoto; Taku Oshima; Satoshi Oyama; Noriko Saito; Gen-Ichi Sampei; Yu-Ji Satoh; Suharnan Sivasundaram; Hideaki Tagami; Hideyuki Takahashi; Jun-Ichi Takeda; Keiko Takemoto; Kazuyuki Uehara; Chieko Wada; Sayaka Yamagata; Takashi Horiuchi
DNA Research, 4, 2, 91-113, 1997, Peer-reviwed
Scientific journal, English - DNA implementation of simple Horn clause computation
S Kobayashi; T Yokomori; G Sampei; K Mizobuchi
PROCEEDINGS OF 1997 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON EVOLUTIONARY COMPUTATION (ICEC '97), 213-217, 1997, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - A 718-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 12.7-28.0 min region on the linkage map
Taku Oshima; Hiroji Aiba; Tomoya Baba; Katsutoshi Fujita; Kouji Hayashi; Atsuko Honjo; Keiichi Ikemoto; Toshifumi Inada; Takeshi Itoh; Miwako Kajihara; Kiyotaka Kanai; Kaoru Kashimoto; Sigenobu Kimura; Masanari Kitagawa; Kozo Makino; Shinji Masuda; Takeyoshi Miki; Kiyoshi Mizobuchi; Hirotada Mori; Kouji Motomura; Yoshikazu Nakamura; Hiroko Nashimoto; Yoshitaka Nishio; Noriko Saito; Gen-Ichi Sampei; Yasushi Seki; Hideaki Tagami; Keiko Takemoto; Chieko Wada; Yoshihiro Yamamoto; Minoru Yano; Takashi Horiuchi
DNA Research, Universal Academy Press Inc., 3, 3, 137-155, 1996, Peer-reviwed
Scientific journal, English - A 570-kb DNA sequence of the escherichia coli K-12 genome corresponding to the 28.0-40.1 min region on the linkage map
Hiroji Aiba; Tomoya Baba; Kouji Hayashi; Toshifumi Inada; Katumi Isono; Takeshi Itoh; Hiroaki Kasai; Kaoru Kashimoto; Shigenobu Kimura; Madoka Kitakawa; Masanari Kitagawa; Kozo Making; Takeyoshi Miki; Kiyoshi Mizobuchi; Hirotada Mori; Tomoko Mori; Kouji Motomura; Shinsuke Nakade; Yoshikazu Nakamura; Hiroko Nashimoto; Yoshitaka Nishio; Taku Oshima; Noriko Saito; Gen-Ichi Sampei; Yasushi Seki; Suharnan Sivasundaram; Hideaki Tagami; Jun-Ichi Takeda; Keiko Takemoto; Yasushi Takeuchi; Chieko Wada; Yoshihiro Yamamoto; Takashi Horiuchi
DNA Research, Universal Academy Press Inc., 3, 6, 363-377, 1996, Peer-reviwed
Scientific journal, English - A 460-kb DNA sequence of the escherichia coli K-12 genome corresponding to the 40.1-50.0 min region on the linkage map
Takeshi Itoh; Hiroji Aiba; Tomoya Baba; Kouji Hayashi; Toshifumi Inada; Katumi Isono; Hiroaki Kasai; Shigenobu Kimura; Madoka Kitakawa; Masanari Kitagawa; Kozo Making; Takeyoshi Miki; Kiyoshi Mizobuchi; Hirotada Mori; Tomoko Mori; Kouji Motomura; Shinsuke Nakade; Yoshikazu Nakamura; Hiroko Nashimoto; Yoshitaka Nishio; Taku Oshima; Noriko Saito; Gen-Ichi Sampei; Yasushi Seki; Suharnan Sivasundaram; Hideaki Tagami; Jun-Ichi Takeda; Keiko Takemoto; Chieko Wada; Yoshihiro Yamamoto; Takashi Horiuchi
DNA Research, Universal Academy Press Inc., 3, 6, 379-392, 1996, Peer-reviwed
Scientific journal, English - STRUCTURAL COMPARISON OF THE FREE AND DNA-BOUND FORMS OF THE PURINE REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN
A NAGADOI; S MORIKAWA; H NAKAMURA; M ENARI; K KOBAYASHI; H YAMAMOTO; G SAMPEI; K MIZOBUCHI; MA SCHUMACHER; RG BRENNAN; Y NISHIMURA
STRUCTURE, 3, 11, 1217-1224, Nov. 1995, Peer-reviwed
Scientific journal, English - Conformational changes of purine repressor DNA-binding domain upon complexation with DNA
Nagadoi, A; Nakazawa, K; Morikawa, S; Nakamura, H; Sampei, G; Mizobuchi, K; Yamamoto, H; Schumacher, M. A; Brennan, R. G; Nishimura, Y
Nucleic Acids Symp. Ser., 63-64, 1995, Peer-reviwed
International conference proceedings, English - 15N and 13C labeling of Escherichia coli tRNAs toward the NMR analysis
Kawai, G; Takayanagi, M; Hayashi, N; Niimi, T; Sampei, G; Mizobuchi, K; Miyazawa,T; Yokoyama, S; Watanabe, K
Nucleic Acids Symp. Ser., 131-132, 1992
International conference proceedings, English - Regulatory Network Coregulated by PurR/PUR box System
Sampei, G; Yonetani, Y; Nakamura, K; Mizobuchi, K
Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on Molecular Genetics of Bacteria and Phages, 176, Aug. 1990
International conference proceedings, English - Identification and Sequence Analysis of Escherichia coli purE and purK Genes Encoding 5'-Phosphoribosyl-5-Amino-4-imidazole Carboxylase for De Novo Purine Biosynthesis
Wakako Watanabe; Gen-ichi Sampei; Atsu Aiba; Kiyoshi Mizobuchi
Journal of Bacteriology, 171, 1, 198-204, Dec. 1989, Peer-reviwed
Scientific journal, English - THE ORGANIZATION OF THE PURL GENE ENCODING 5'-PHOSPHORIBOSYLFORMYLGLYCINAMIDE AMIDOTRANSFERASE OF ESCHERICHIA-COLI
G SAMPEI; K MIZOBUCHI
Lead, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 264, 35, 21230-21238, Dec. 1989, Peer-reviwed
Scientific journal, English - NUCLEOTIDE-SEQUENCE OF THE ESCHERICHIA-COLI PURF GENE ENCODING AMIDOPHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE FOR DE-NOVO PURINE NUCLEOTIDE SYNTHESIS
G SAMPEI; K MIZOBUCHI
Lead, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 16, 17, 8717-8717, Sep. 1988, Peer-reviwed
Scientific journal, English
Books and other publications
Lectures, oral presentations, etc.
- 高度好熱菌プリンオペロンに存在するorfの遺伝子破壊と表現型解析
佐々木 麗央; 三瓶 嚴一
Poster presentation, Japanese, 第43回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, オンライン
02 Dec. 2020 - ヌクレオチド合成系の起源と進化
三瓶嚴一
Invited oral presentation, Japanese, 生物環境イノベーション研究部門・公開シンポジウム ~生物進化の立場から生物環境を考える~, Invited, 東京理科大学 研究推進機構 総合研究院, 東京理科大学葛飾キャンパス図書館ホール, Domestic conference
12 Nov. 2020 - 高度好熱菌ピリミジンヌクレオチド生合成系オペロンの転写開始点解析
齊藤 有紀; 小池 奈緒美; 青木 優里; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Poster presentation, Japanese, 第42回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
06 Dec. 2019 - 2種類の高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来PRPP synthetaseの酵素活性
若林 新; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Poster presentation, Japanese, 第42回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 福岡
03 Dec. 2019 - NGS解析による高度好熱菌からの新規small non-coding RNAの探索
青木 優里; 小池 奈緒美; 齊藤 有紀; 三瓶 嚴一; 河合 剛太
Poster presentation, Japanese, 第41回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
30 Nov. 2018 - 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来IMP dehydrogenase (GuaB)の酵素活性特性の評価
計良 哲巧; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Poster presentation, Japanese, 第41回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
30 Nov. 2018 - 好熱好酸性アーキアSulfolobus tokodaii由来プリンヌクレオチド生合成の酵素FAICAR synthetaseの構造機能解析
三五 ちはる; 三瓶 嚴一; 河合 剛太; 根本 直樹
Poster presentation, Japanese, 第41回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
28 Nov. 2018 - 好熱好酸性アーキアSulfolobus tokodaii由来プリンヌクレオチド生合成の酵素FAICAR
三五 ちはる; 三瓶 嚴一; 河合 剛太; 根本 直樹
Poster presentation, Japanese, 第41回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
28 Nov. 2018 - Thermus thermophilus 由来チミジル酸合成酵素の立体構造とC末端ドメインの機能の解析
小川 青葉; 三瓶 嚴一; 河合 剛太
Poster presentation, Japanese, 第41回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
28 Nov. 2018 - 高度好熱菌ピリミジンヌクレオチド生合成系オペロンの転写開始点解析
齊藤 有紀; 小池 奈緒美; 青木 優里; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Poster presentation, Japanese, 第41回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
28 Nov. 2018 - 高度好熱菌プリンヌクレオチド生合成系オペロンの転写開始点解析
小池 奈緒美; 青木 優里; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Poster presentation, Japanese, 第41回日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会, 横浜
28 Nov. 2018 - Gene organizations and their regulation in the nucleotide biosynthetic pathway
Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Poster presentation, English, International Workshop on 50th Anniversary of Thermus thermophilus Discovery, Thermus thermophilus Anniversary Committee, Atagawa-Heights Training Center, Izu, Shizuoka, Japan, International conference
28 Sep. 2018 - 好熱性メタン菌由来purPとpurOによる大腸菌purH遺伝子の相補
天貝 雄歩; 三瓶 嚴一; 河合 剛太; 根本 直樹
Poster presentation, Japanese, 生命科学系学会合同年次大会,第40回日本分子生物学会年会,第90回日本生化学会大会, 日本分子生物学会,日本生化学会, 神戸
08 Dec. 2017 - 好熱性メタン菌由来purPとpurOによる大腸菌purH遺伝子の相補
天貝 雄歩; 三瓶 嚴一; 河合 剛太; 根本 直樹
Poster presentation, Japanese, 生命科学系学会合同年次大会,第40回日本分子生物学会年会,第90回日本生化学会大会, 日本分子生物学会,日本生化学会, 神戸
08 Dec. 2017 - DNAマイクロアレイと次世代シーケンサーによるThermus themophilus HB8のRNomics
河合 剛太; 青木 優里; 大津 舞菜; 小池 奈緒美; 三瓶 嚴一
Poster presentation, Japanese, 生命科学系学会合同年次大会,第40回日本分子生物学会年会,第90回日本生化学会大会, 日本分子生物学会,日本生化学会, 神戸
06 Dec. 2017 - プリンヌクレオチド生合成系の編成
三瓶 嚴一; 河合 剛太
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第3回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
06 Sep. 2017 - 高度好熱菌プリンヌクレオチド生合成系オペロンのリプレッサーに関する研究
橋本 晃成; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第3回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Sep. 2017 - 高度好熱菌由来プリンヌクレオチド生合成系の初期2段階に関与するPurF・PurDに関する研究
山岡 翔一; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第3回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Sep. 2017 - 高度好熱菌由来IMP脱水素酵素(GuaB)の活性測定と結晶化
計良 哲巧; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第3回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Sep. 2017 - 高度好熱菌プリンヌクレオチド生合成系におけるオペロンの転写開始点の解析
小池 奈緒美; 河合 剛太; 青木 優里; 大津 舞菜; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第3回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Sep. 2017 - 高度好熱菌ピリミジンヌクレオチド生合成系におけるオペロンの転写開始点の解析
齊藤 有紀; 河合 剛太; 青木 優里; 大津 舞菜; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第3回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Sep. 2017 - Organization in the nucleotide synthetic gene
三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 第39回日本分子生物学会年会, The Molecular Biology Society of Japan, 横浜
02 Dec. 2016 - プリンヌクレオチド生合成系における反応の系統的理解
河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 第89回日本生化学会大会, 日本生化学会, 仙台
26 Sep. 2016 - 高度好熱菌由来PRPP合成酵素(TtPrs)の結晶化と活性測定
青木 秀彰; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第2回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Aug. 2016 - 高度好熱菌由来PurUの活性測定
佐藤 広大; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第2回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Aug. 2016 - 高度好熱菌由来PurK,PurEの立体構造解析および相互作用解析
下邨 正裕; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第2回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Aug. 2016 - 高度好熱菌プリンヌクレオチド生合成系オペロンの発現制御に関する研究
橋本 晃成; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第2回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Aug. 2016 - 高度好熱菌由来 グルタミンPRPPアミドトランスフェラーゼに関する研究
山岡 翔一; 河合 剛太; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第2回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Aug. 2016 - 高度好熱菌由来PurHの構造解析と機能解析
峯山 元輝; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第2回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
05 Aug. 2016 - プリンヌクレオチド生合成系遺伝子群の編成
河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会, 日本分子生物学会、日本生化学会, 神戸
03 Dec. 2015 - プリンヌクレオチド合成系の進化
三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会, 日本分子生物学会、日本生化学会, 神戸
03 Dec. 2015 - ゲノム,遺伝子編成に関する問題提起
三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第1回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
10 Sep. 2015 - GMP合成に関与するGuaB,GuaAの構造解析および相互作用解析
山下 惇; 三瓶 嚴一
Oral presentation, Japanese, 生命システム原材料の起源と進化研究会第1回研究交流会, 千葉県御宿, Domestic conference
09 Sep. 2015 - Origin and evolution of the protein structures in the purine biosynthetic pathway : Reaction mechanism of N5-CAIR synthetase (PurK) and evolutionary relationships with related enzymes
Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, 第87回日本生化学会大会, Domestic conference
Oct. 2014 - Crystal structures of PurM proteins from thermophiles
Mayumi Kanazawa; Seiki Baba; Yuzo Watanabe; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, 第87回日本生化学会大会, Domestic conference
Oct. 2014 - Sulfolobus tokodaii 由来PurQタンパク質の無細胞合成系による調製とグルタミナーゼ活性の確認
渡辺雄三; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 第87回日本生化学会大会, Domestic conference
Oct. 2014 - Modular evolution of the enzymes in the purine biosynthetic pathway
Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2014 - Reaction mechanism of glutamine amidotranferases in the purine biosynthesis
Yuzo Watanabe; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2014 - Interaction analysis between PurF and PurD from Thermus thermophilus HB8
Hironori Ishii; Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2014 - Molecular evolution of the enzymes in the purine biosynthetic pathway
Gota Kawai; Yuzo Watanabe; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2013 - Structural and functionalanalyses of formylglycinamide ribonucleotide amidotransferase
Yuzo Watanabe; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2013 - Molecular evolution of enzymes in the purine biosynthetic pathway
河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 第86回日本生化学会大会, The Japanese Biochemical Society, 横浜
Sep. 2013 - Origin and evolution of the protein structures in the purine biosynthetic pathway
Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, Japanese, 電気通信大学生命科学シンポジウム 『生命システム原材料の起源と進化:生化学的禁制律』, The University of Electro-Communications, 東京
Mar. 2013 - Crystal structure of PurU from Thermus thermophilus HB8
Yuki Yanagida; Naoki Ogata; Mayumi Kusano; Mayumi Kanagawa; Yumiko Inoue; Seiki Baba; Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2012 - Crystal structure of PurC from Sulfolobus tokodaii
Ryosuke Umebayashi; Mayumi Kanagawa; Seiki Baba; Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2012 - Origin and evolution of the enzymes in the purine biosynthetic pathway: an analysis in view of protein structures
Gen-ichi Sampei; Seiki Baba; Mayumi Kanagawa; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2012 - Reaction mechanisms of the two related enzymes, PurN and PurU
Mayumi Kusano; Toshiaki Shimasaki; Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, Whole-organism science society Meeting of structural-biological whole cell project
Sep. 2012 - Origin and evolution of the protein structures in the purine biosynthetic pathway
Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, Japanese, 2011理研・千葉工業大学共催シンポジウム「生命システム原材料の起源と進化:生体分子は如何にして作られたか?」, RIKEN and Chiba Institute of Technology, 東京
Nov. 2011 - Origin and evolution of the protein structures in the purine biosynthetic pathway
Gen-ichi Sampei; Gota Kawai
Oral presentation, Japanese, 第84回日本生化学会大会, The Japanese Biochemical Sopciety, 京都
Sep. 2011 - Dissecting enzyme mechanisms in the purine nucleotides biosynthetic pathway
Gota Kawai; Mayumi Kusano; Seiki Baba; Mayumi Kanagawa; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, Japanese, モデル生物丸ごと一匹学会 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,第1回 モデル生物丸ごと一匹学会 第10回 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会 共催
Aug. 2011 - Thermus thermophilus HB8プリンヌクレオチド生合成系オペロンの発現機構解析
山本秀哉; 渡辺大河; 松浦周作; 中島健太; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, モデル生物丸ごと一匹学会 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,第1回 モデル生物丸ごと一匹学会 第10回 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会 共催
Aug. 2011 - Sulfolobus tokodaii由来GMP合成酵素のX線結晶構造解析
鷲尾浩伸; 斎藤祐介; 渡辺拓也; 籠谷典亮; 田村さと子; 鈴木咲子; 金川真由美; 馬場清喜; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, モデル生物丸ごと一匹学会 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,第1回 モデル生物丸ごと一匹学会 第10回 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会 共催
Aug. 2011 - Crystal structure of PurF from Sulfolobus tokodaii
宮澤良太; 梅林亮輔; 柳田優輝; 岡田潔; 金川真由美; 馬場清喜; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, モデル生物丸ごと一匹学会 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,第1回 モデル生物丸ごと一匹学会 第10回 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会 共催
Aug. 2011 - 立体構造から見たプリンヌクレオチド生合成系タンパク質の起源と進化
河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会, 日本分子生物学会、日本生化学会, 神戸
Dec. 2010 - N
5-CAIR synthetase (PurK)の基質認識メカニズムの解析
三瓶 嚴一; 高 広行; 田村 さと子; 馬場 清喜; 河合 剛太
Oral presentation, Japanese, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会, International conference
Sep. 2010 - Thermotoga maritima由来PurKの結晶構造解析
宮澤良太; 金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第9回連携研究会
Aug. 2010 - プリン・ピリミジンヌクレオチド生合成系の丸ごと解析
三瓶嚴一; 宮澤良太; 山本秀哉; 鈴木咲子; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第9回連携研究会
Aug. 2010 - 高度高熱菌における新規低分子RNAの検索
河合剛太; 伊藤寛啓; 島田彬人; 倉光成紀; 三瓶嚴一; 別所義隆
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第9回連携研究会
Aug. 2010 - Geobacillus kaustophilus由来PurHの結晶構造解析
三井翔平; 金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第32回日本分子生物学会年会
Dec. 2009 - プリン・ピリミジンヌクレオチド生合成系の丸ごと解析
河合剛太; 鈴木咲子; 三井翔平; 金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第8回連携研究会
Aug. 2009 - Thermus thermophilus 由来PurLの結晶構造解析
鈴木咲子; 矢内久陽; 金川真由美; 田村さと子; 渡邊雄三; 布施亨太郎; 馬場清貴; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第8回連携研究会
Aug. 2009 - Geobacillus kaustophilus由来PurHの結晶構造解析
三井翔平; 金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第8回連携研究会
Aug. 2009 - Sulfolobus tokodaii由来PurSタンパク質の結晶構造解析
鈴木咲子; 田村さと子; 岡田潔; 馬場清喜; 熊坂崇; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会、日本生化学会,第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
Dec. 2008 - プリン・ピリミジンヌクレオチド生合成系の丸ごと解析
三瓶嚴一; 高広行; 松浦周作; 鈴木咲子; 金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
Sep. 2008 - Thermus thermophilus HB8由来PurAの結晶構造及び機能解析
高広行; 金川真由美; 北村吉章; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
Sep. 2008 - Sulfolobus tokodaii由来PurSタンパク質の結晶構造解析
鈴木咲子; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
Sep. 2008 - Crystal structures of GAR transformylase 1 (PurN) from A. aeolicus, S. toebii and G. kaustophilus
Gota Kawai; Mayumi Kanagawa; Seiki Baba; Takeshi Nagira; Yayoi Fujimoto; Ryosuke Oonishi; Noriko Ito; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Seiki Kuramitsu; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, English, International Union of Crystallography
Aug. 2008 - Crystal structures of GAR synthetase (PurD) from A. aeolicus, G. kaustophilus and T. thermophilus
Seiki Baba; Mayumi Kanagawa; Hisaaki Yanai; Takeshi Ishii; Nobuko Maoka; Nagisa Takemoto; Noriko Ito; Miwa Ohmori; Yayoi Fujimoto; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Seiki Kuramitsu; Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, English, International Union of Crystallography
Aug. 2008 - Structural genomics on the purine nucleotides biosynthetic pathway
Gen-ichi Sampei; Seiki Baba; Mayumi Kanagawa; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Seiki Kuramitsu; Gota Kawai
Oral presentation, English, International Union of Crystallography
Aug. 2008 - Crystal structures of N5-CAIR synthetase (PurK) from A. aeolicus, T. thermophilus and S. tokodaii
Hiroyuki Taka; Satoko Tamura; Satoshi Tsunoda; Kiyoshi Okada; Seiki Baba; Mayumi Kanagawa; Miho Manzoku; Yukiko Utsunomiya; Masami Nishida; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Seiki Kuramitsu; Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, English, International Union of Crystallography
Aug. 2008 - Crystal structure of GMP synthetase (GuaA) from T. thermophilus
Mayumi Kanagawa; Seiki Baba; Hiroya Kawai; Yoko Fukai; Yumiko Inoue; Noriko Nakagawa; Akio Ebihara; Seiki Kuramitsu; Gota Kawai; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, English, International Union of Crystallography
Aug. 2008 - Aquifex aeolicus VF5由来PurKタンパク質の結晶構造解析
田村さと子; 岡田潔; 馬場清喜; 金川真由美; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会、日本生化学会,第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
Dec. 2007 - Sulfolobus tokodaii由来のdCTP deaminaseの結晶構造解析 :ピリミジンヌクレオチド合成系のシステム生物学に向けて
金川真由美; 馬場清喜; 海老原章郎; 倉光成紀; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会、日本生化学会,第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
Dec. 2007 - プリン・ピリミジンヌクレオチド生合成系の丸ごと解析
河合剛太; 田村さと子; 金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第6回連携研究会
Aug. 2007 - Thermus thermophilus HB8のシステム生物学に向けて:Thermus thermophilus HB8由来GuaB,GuaA,PurAおよびPurBの結晶構造と機能
金川真由美; 馬場清喜; 海老原章郎; 倉光成紀子; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第6回連携研究会
Aug. 2007 - Geobacillus kaustophilus 由来PurDタンパク質の結晶構造解析
馬場清喜; 金川真由美; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第6回連携研究会
Aug. 2007 - Thermus thermophilus HB8における遺伝子間領域の発現解析
伊藤寛啓; 中川紀子; 倉光成紀; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第5回連携研究会
Aug. 2006 - Geobacillus kaustophilus 由来PurDタンパク質の結晶構造解析
馬場清喜; 金川真由美; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第5回連携研究会
Aug. 2006 - Aquifex aeolicus 由来PurKタンパク質の結晶構造解析
金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第5回連携研究会
Aug. 2006 - Thermus thermophilus HB8由来PurKタンパク質の結晶構造解析
角田悟; 奥田健司; 馬場清喜; 金川真由美; 中川紀子; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第5回連携研究会
Aug. 2006 - プリン・ピリミジンヌクレオチド生合成系の丸ごと解析
河合剛太; 田村さと子; 角田悟; 奥田健司; 岡田潔; 金川真由美; 馬場清喜; 中川紀子; 海老原章郎; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第5回連携研究会
Aug. 2006 - プラスミドゲノムの編成と多様性に関する研究:IncMプラスミドpIP135のゲノム解析
冨永健一郎; 溝渕潔; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第28回日本分子生物学会年会
Dec. 2005 - 高度好熱菌Thermus thermophilus トリプトファン生合成系オペロンの発現解析
大島裕二; 秋林淳; 長岡克浩; 玉腰雅忠; 山岸明彦; 倉光成紀; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第28回日本分子生物学会年会
Dec. 2005 - Thermus thermophilus HB8由来GAR synthetaseの結晶構造
三瓶嚴一; 石井健; 矢内久陽; 馬場清喜; 真岡伸子; 中川紀子; 金川真由美; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第28回日本分子生物学会年会
Dec. 2005 - DNAマイクロアレイによる高度好熱菌ゲノムの遺伝子間領域の発現解析
伊藤寛啓; 柏原愛子; 吉良聡; 中川紀子; 倉光成紀; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第28回日本分子生物学会年会
Dec. 2005 - Thermus thermophilus HB8由来PurDタンパク質の結晶構造解析
三瓶嚴一; 石井健; 矢内久陽; 馬場清喜; 真岡伸子; 中川紀子; 金川真由美; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第4回連携研究会
Aug. 2005 - Thermus thermophilus HB8プリンヌクレオチド生合成系蛋白質PurS(TTHA1516)の結晶構造解析
矢内久陽; 金川真由美; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第4回連携研究会
Aug. 2005 - DNAマイクロアレイによる遺伝子間領域の発現解析
伊藤寛啓; 柏原愛子; 吉良聡; 中川紀子; 倉光成紀; 三瓶嚴一; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第4回連携研究会
Aug. 2005 - プラスミドゲノムの編成と多様性に関する研究:IncFVプラスミドF0lacのゲノム解析
外山拓哉; 三瓶嚴一; 溝渕潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第27回日本分子生物学会年会
Dec. 2004 - 高度好熱菌PurDタンパク質の結晶構造解析
三瓶嚴一; 石井健; 矢内久陽; 馬場清喜; 真岡伸子; 中川紀子; 金川真由美; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 日本結晶学会,日本結晶学会年会2005
Nov. 2004 - 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来GMP synthetaseの結晶構造
石井健; 馬場清喜; 金川真由美; 矢内久陽; 河合宏哉; 海老原章郎; 中川紀子; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第3回連携研究会
Jul. 2004 - Efficient Alignment Method for RNA Secondary Structures Including Pseudoknots
Shinnosuke Seki; Atsushi Kijima; Satoshi Kobayasi; Gen-ichi Sampei
Oral presentation, English, IPSJ SIG Technical Report
2004 - 高度好熱菌グアニレートキナーゼの結晶構造解析
三瓶嚴一; 金川真由美; 矢内久陽; 石井健; 河合宏哉; 深井陽子; 寺尾佳代子; 中川紀子; 真岡伸子; 河合剛太
Oral presentation, Japanese, 日本結晶学会,日本結晶学会年会2003
Dec. 2003 - 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来GMP synthetaseの結晶構造
矢内久陽; 金川真由美; 石井健; 河合宏哉; 深井陽子; 海老原章郎; 中川紀子; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第26回日本分子生物学会年会
Dec. 2003 - Organization of the genes of purine nucleotide biosynthetic pathway -Approach from 3D structure of gene products-
Gen-ichi Sampei; Hisaaki Yanai; Takeshi Ishii; Hiroya Kawai; Yoko Fukai; Mayumi Kanagawa; Gota Kawai
Oral presentation, English, Annual Meeting of Structural-Biological Whole Cell Project of Thermus thermophilus HB8
Aug. 2003 - プラスミドの編成と多様性に関する研究:IncFIIIプラスミドColB-K98のゲノム解析
黒田隆平; 三瓶嚴一; 溝渕潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第25回日本分子生物学会年会
Dec. 2002 - 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8のプリンヌクレオチド生合成系タンパク質の立体構造解析
金川真由美; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクトストラクチュローム連携研究会,理研セミナー高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第1回ストラクチュローム連携研究会
Jul. 2002 - トレオニン、メチオニン生合成系遺伝子群の編成
三瓶嚴一; 常松拓司; 秦 昌史; 溝渕 潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第24回日本分子生物学会年会
Dec. 2001 - 高度好熱菌プリン合成系タンパク質の結晶化
金川真由美; 寺尾佳代子; 増井良治; 柴田武彦; 井上頼直; 野嶽勇一; 石嶋 潤; 横山茂之; 倉光成紀; 高久 洋; 濡木 理; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本結晶学会,日本結晶学会年会2001
Oct. 2001 - 高度高熱菌guanylate kinaseの結晶化
金川真由美; 増井良治; 柴田武彦; 井上頼直; 横山茂之; 倉光成紀; 高久 洋; 河合剛太; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本結晶学会,日本結晶学会2000年度年会
Oct. 2000 - プリンヌクレオチド生合成系遺伝子群の編成
三瓶嚴一; 芝 清隆; 溝渕 潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会年会,第22回日本分子生物学会年会
Dec. 1999 - 機能モジュールの「組み合わせ」によるゲノム多様性の分子機構
溝渕 潔; 斎藤裕弘; 鈴木卓司; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会年会,第22回日本分子生物学会年会
Dec. 1999 - 遺伝子の「組み合わせ」によるゲノム多様性の獲得
芝 清隆; 三瓶嚴一; 茂木浩未; 野田哲生; 溝渕 潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第21回日本分子生物学会年会
Dec. 1998 - IncI1プラスミドR64の全ゲノム解析
駒野照弥; 佐々木孝寛; 立花恵子; 古屋伸久; 斉藤裕弘; 鈴木卓司; 三瓶嚴一; 溝渕 潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第21回日本分子生物学会年会
Dec. 1998 - プラスミドゲノムの編成と多様性に関する研究:IncF2プラスミドR100の全ゲノム解析
三瓶嚴一; 関 也寸志; 清水宏明; 溝渕 潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会,第21回日本分子生物学会年会
Dec. 1998 - プラスミドゲノムの編成と多様性に関する研究:Fプラスミドの全ゲノム解析
清水宏明; 上原一晃; 三瓶嚴一; 溝渕 潔
Oral presentation, Japanese, 日本分子生物学会年会,第21回日本分子生物学会年会
Dec. 1998 - ゲノムの編成と多様化
溝渕 潔; 三瓶嚴一
Oral presentation, Japanese, 日本生物物理学会,第36回日本生物物理学会
Sep. 1998 - 乳酸菌プラスミドpLY101の全塩基配列
三瓶嚴一; 上原一晃; 溝渕 潔; 門多真理子; 白沢幸生; 郷木達雄
Oral presentation, Japanese, 日本乳酸菌学会,1998年度日本乳酸菌学会研究集会
Jul. 1998 - Lactobacillus casei シロタ株の染色体上に存在するラクトースオペロンの構造
白沢幸生; 木脇真祐美; 上原一晃; 三瓶嚴一; 溝渕 潔; 門多真理子
Oral presentation, Japanese, 日本乳酸菌学会,1998年度日本乳酸菌学会研究集会
Jul. 1998 - プリンリプレッサーDNA結合ドメインの構造変化
馮 梅; 長土居 有隆; 三瓶 嚴一; 溝渕 潔; 西村 善文
Oral presentation, Japanese, 日本生物物理学会,第35回日本生物物理学会
Sep. 1997 - Organization and diversification of the genome of plasmid ColIb-P9
Koji Motomura; Shinji Masuda; Yasushi Seki; Gin-ichi Sampei; Kiyoshi Mizobuchi
Oral presentation, English, Intenational Workshop on Recent Advance in Genome Biology of Micro-organisms, Kazusa DNA Research Institute, Makuhari
Oct. 1996 - PurRタンパク質DNA結合領域の2D-プロトンNMRによる構造解析
江成 政人; 山本 康裕; 三瓶 嚴一; 溝渕 潔; 西村 善文
Oral presentation, Japanese, 日本生物物理学会,第29回日本生物物理学会
Sep. 1991
Courses
- K課程輪講
The University of Electro-Communications - K課程輪講
電気通信大学 - 化学生命工学実験第二
電気通信大学 - 化学生命工学実験第一
電気通信大学 - Instrumental Analysis
The University of Electro-Communications - 機器分析学
電気通信大学 - General Biochemistry
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電気通信大学 - Molecular Biology
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The University of Electro-Communications - 生体機能システム実験第二
電気通信大学 - Bioscience and Technology Laboratory Ⅰ
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